終了配列要件は、RNAポリメラーゼIIIによって転写された遺伝子によって異なります

RNAポリメラーゼIII（POL III）転写は一般に、4つ以上のチミジン（T）残基の走行で終了しますが、一部のPOL III遺伝子には、終端シグナルとして認識されていないT残基の実行が含まれています。ここでは、アデノウイルスウイルス関連（VA）RNA遺伝子で機能する末端信号要件を調査します。Xenopus 5 S RNA遺伝子では、効率的な終了にはT残基がG+Cリッチシーケンスコンテキストにある必要がありますが、G+Cリッチコンテキストで5つのT残基の実行は、30に配置するとPOL III終了を引き起こしません。VA-TATキメラ遺伝子におけるアデノウイルス-2 VA RNAIプロモーターの下流。Pol IIIがこの推定終了信号を認識できないことは、遺伝子のキメラ性やプロモーターへの信号の近接性によるものではなく、その配列コンテキストによるものです。VA RNA遺伝子部位での終了には、Tリッチ配列が必要であり、G残基の近接によって阻害されますが、残基の存在には鈍感です。ただし、Tリッチシーケンスは途切れない必要はありません。鳥類アデノウイルスのVA RNA遺伝子であるCELOでは、2つのタンデム終了信号の最初には、高（完全ではない）効率を持つターミネーターとして機能するTTATTの中断されたTTATTが含まれています。これらの調査結果は、他のPoL III遺伝子の末端部位に隣接する配列の調査とともに、Pol III終了信号はこれまで認識されていたよりも複雑であり、クラス1とクラス2のメンバー間でシーケンスコンテキスト要件が異なるという結論につながります。Pol III遺伝子のファミリー。

RNA polymerase III (pol III) transcription generally terminates at a run of four or more thymidine (T) residues but some pol III genes contain runs of T residues that are not recognized as termination signals. Here, we investigate the terminal signal requirements that are operative in adenovirus virus-associated (VA) RNA genes. In the Xenopus 5 S RNA gene, efficient termination requires the T residues to be in a G+C-rich sequence context, but a run of five T residues in a G+C-rich context does not cause pol III termination when placed 30 nt downstream of the adenovirus-2 VA RNAI promoter in a VA-Tat chimeric gene. The failure of pol III to recognize this putative termination signal is not due to the chimeric nature of the gene or to the proximity of the signal to the promoter, but to its sequence context. Termination at the VA RNA gene site requires a T-rich sequence and is inhibited by the proximity of G residues, but is insensitive to the presence of A residues. The T-rich sequence need not be uninterrupted, however. In the VA RNA gene of the avian adenovirus, CELO, the first of two tandem termination signals contains an interrupted run of T residues, TTATT, which functions as a terminator with high (although not complete) efficiency. These findings, together with a survey of sequences neighboring the terminal site of other pol III genes, lead to the conclusion that pol III termination signals are more complex than hitherto recognized, and that sequence context requirements differ between members of the class 1 and class 2 families of pol III genes.