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10種のアブラナ科からNADHサブユニット4（NAD4）のミトコンドリア（MT）遺伝子の最初のイントロンの16のヌクレオチド配列（それぞれ約1400 bp）を得ました。これらの新しいシーケンスとGenBankの5つの公開されたシーケンスを使用して、研究中のアブラナ科の系統樹を構築し、NAD4の最初のイントロンのヌクレオチド置換速度が非常に低く、約0.16-0.23 x 10（-9）であることを示しました。NAD4のエクソンのサイレントレートの約半分である年間のサイトあたりの代替。このイントロン、IT、およびIGの置換速度の比率は約1:23:73であり、18Sから25S RRNA遺伝子の核間スペーサーであり、IGSは5S RRNA遺伝子の遺伝子間スペーサーです。小麦に存在しないアブラナ科種のNAD4の最初のイントロンのセグメント（335 bp）は、非機能的配列と見なされ、mtDNAの中性速度（変異速度）を0.5-0.7 x 10（ - ）推定するために使用されました（ - 9）年間のサイトごとの置換。これは、NAD4の最初のイントロンの残りの部分の置換率の約3倍です。発散の日付は、モノコット・ディコット分裂の場合は170〜235百万年（MYR）、アブラナ科 - レティス分裂のための112-156 Myr、アブラナ科 - アラビドプシス分裂の14.5-20.4 Myr、および14.5-20.4 myrと推定されました。シロイヌナズナ - アラビデ科の分裂。
10種のアブラナ科からNADHサブユニット4（NAD4）のミトコンドリア（MT）遺伝子の最初のイントロンの16のヌクレオチド配列（それぞれ約1400 bp）を得ました。これらの新しいシーケンスとGenBankの5つの公開されたシーケンスを使用して、研究中のアブラナ科の系統樹を構築し、NAD4の最初のイントロンのヌクレオチド置換速度が非常に低く、約0.16-0.23 x 10（-9）であることを示しました。NAD4のエクソンのサイレントレートの約半分である年間のサイトあたりの代替。このイントロン、IT、およびIGの置換速度の比率は約1:23:73であり、18Sから25S RRNA遺伝子の核間スペーサーであり、IGSは5S RRNA遺伝子の遺伝子間スペーサーです。小麦に存在しないアブラナ科種のNAD4の最初のイントロンのセグメント（335 bp）は、非機能的配列と見なされ、mtDNAの中性速度（変異速度）を0.5-0.7 x 10（ - ）推定するために使用されました（ - 9）年間のサイトごとの置換。これは、NAD4の最初のイントロンの残りの部分の置換率の約3倍です。発散の日付は、モノコット・ディコット分裂の場合は170〜235百万年（MYR）、アブラナ科 - レティス分裂のための112-156 Myr、アブラナ科 - アラビドプシス分裂の14.5-20.4 Myr、および14.5-20.4 myrと推定されました。シロイヌナズナ - アラビデ科の分裂。
We obtained 16 nucleotide sequences ( approximately 1400 bp each) of the first intron of the mitochondrial (mt) gene for NADH subunit 4 (nad4) from 10 species of Brassicaceae. Using these new sequences and five published sequences from GenBank, we constructed a phylogenetic tree of the Brassicaceae species under study and showed that the rate of nucleotide substitution in the first intron of nad4 is very low, about 0.16-0.23 x 10(-9) substitution per site per year, which is about half of the silent rate in exons of nad4. The ratios of substitution rates in this intron, ITS, and IGS are approximately 1:23:73, where ITS is the nuclear intergenic spacer between 18S and 25S rRNA genes and IGS is the intergenic spacer of 5S rRNA genes. A segment (335 bp) in the first intron of nad4 in Brassicaceae species that is absent in wheat was considered as a nonfunctional sequence and used to estimate the neutral rate (the rate of mutation) in mtDNA to be 0.5-0.7 x 10(-9) substitution per site per year, which is about three times higher than the substitution rate in the rest of the first intron of nad4. We estimated that the dates of divergence are 170-235 million years (Myr) for the monocot-dicot split, 112-156 Myr for the Brassicaceae-Lettuce split, 14.5-20.4 Myr for the Brassica-Arabidopsis split, and 14.5-20.4 Myr for the Arabidopsis-Arabideae split.
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