ヒト、マウス、ショウジョウバエのゲノムにおけるジヌクレオチドマイクロサテライトの隣接するヌクレオチド配列

ヒト、マウス、ショウジョウムのゲノムの長いシーケンス部分にダニクレオチドマイクロサテライトを挟むEMBLデータベースからヌクレオチド配列を抽出しました。隣接配列の比較により、マイクロサテライトは、保存された高度に非ランダムで、主に（A+T）リッチ配列を介して、長さが何十ものヌクレオチドを持つ（A+T）豊富な配列を介して、主にゲノムDNAの大部分に接続されていることが示されました。多くの場合、コネクタは、マイクロサテライト中心から距離を置いて配列パターンが徐々に消滅した側面のマイクロサテライトの変異バージョンでした。したがって、多くのマイクロサテライトには、長さが多数のヌクレオチドではなく数百の微小岩があり、その端はびまん性です。対照的に、主にCおよび/またはGを含む一部のマイクロサテライトは、近隣にはまったく影響しませんでした。これらの結果は、マイクロサテライトの性質に関する概念を変えます。彼らはまた、マイクロサテライトが真核生物ゲノムの支配的な部分であることを示しています。

We extracted nucleotide sequences from the EMBL database that flank dinucleotide microsatellites in the long sequenced parts of the human, mouse and drosophila genomes. Comparison of the flanking sequences showed that the microsatellites were mostly connected to the bulk of genomic DNA through conserved, highly non-random and mostly (A+T)-rich sequences having many dozens of nucleotides in length. In many cases, the connectors were mutated versions of the flanked microsatellites whose sequence pattern gradually vanished with the distance from the microsatellite center. Hence many microsatellites have hundreds rather than dozens of nucleotides in length, and their ends are diffuse. In contrast, some microsatellites containing predominantly C and/or G, did not influence their neighborhood at all. These results make us change notions about the microsatellite nature. They also indicate that the microsatellites are the dominant part of eukaryotic genomes.