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Journal of biotechnology1999Oct08Vol.75issue(2-3)

内部標準としてのハウスキーピング遺伝子:使用と制限

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

定量的研究は、さまざまな実験的または臨床状態でのRNA発現を比較するために、生物医学研究で一般的に実現されています。これらの定量化は、グリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ(G3PDH)、アルブミン、アクチン、チューブリン、シクロフィリン、ヒポキサンチンホソフォリボシルトランスフェラーゼ(HRPT)、L32などのハウスキーピング遺伝子転写産物の発現と比較することで実行されます。28S、および18S RRNAも内部標準として使用されます。この論文では、一般的に使用される内部標準は、さまざまな要因に応じて定量的に変化する可能性があることを思い出してください。可能なバリエーションは、3つの実験例を使用して示されています。その後、これらのサンプルのそれぞれについて、好ましいタイプの内部標準が提案され、その後、内部標準の選択とその用途の管理方法に関する一般的な手順について説明します。

定量的研究は、さまざまな実験的または臨床状態でのRNA発現を比較するために、生物医学研究で一般的に実現されています。これらの定量化は、グリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ(G3PDH)、アルブミン、アクチン、チューブリン、シクロフィリン、ヒポキサンチンホソフォリボシルトランスフェラーゼ(HRPT)、L32などのハウスキーピング遺伝子転写産物の発現と比較することで実行されます。28S、および18S RRNAも内部標準として使用されます。この論文では、一般的に使用される内部標準は、さまざまな要因に応じて定量的に変化する可能性があることを思い出してください。可能なバリエーションは、3つの実験例を使用して示されています。その後、これらのサンプルのそれぞれについて、好ましいタイプの内部標準が提案され、その後、内部標準の選択とその用途の管理方法に関する一般的な手順について説明します。

Quantitative studies are commonly realised in the biomedical research to compare RNA expression in different experimental or clinical conditions. These quantifications are performed through their comparison to the expression of the housekeeping gene transcripts like glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (G3PDH), albumin, actins, tubulins, cyclophilin, hypoxantine phsophoribosyltransferase (HRPT), L32. 28S, and 18S rRNAs are also used as internal standards. In this paper, it is recalled that the commonly used internal standards can quantitatively vary in response to various factors. Possible variations are illustrated using three experimental examples. Preferred types of internal standards are then proposed for each of these samples and thereafter the general procedure concerning the choice of an internal standard and the way to manage its uses are discussed.

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