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レインボートラウトフライ症候群とフラボバクテリウム精神菌によって引き起こされる冷水疾患は、養殖サケ科の重要な病気です。FLの検出のために現在利用可能な手法のいくつか。精神菌は時間がかかるか、十分な感度を欠いています。現在の調査では、FLの検出の可能性。魚の組織および水サンプルからの精神菌は、16S RRNA遺伝子の配列に対してDNAプローブを備えたネストされたPCRを使用して調べました。DNAは、Chelex(R)100キレート樹脂を使用して抽出されました。病気の魚、健康な魚、養魚場の環境、参照株から分離された株に対してテストされたプライマーは、FLに特異的であることが証明されました。精神菌。flの取得された検出限界。レインボートラウトの脳組織に播種された精神菌は、PCRチューブで0.4 CFUであり、17 CFU MG-1脳組織に対応していました。PCRアッセイは、FLを注入した虹のマスの脳からの組織サンプルの寒天培養よりも敏感であることが証明されました。精神菌。flを播種した非滅菌淡水で。Psychrophilum PCRアッセイの検出限界は、PCRチューブで1.7 CFUであり、110 CFU ML-1水に対応していました。PCRアッセイはFLを検出しました。レインボートラウト農場から採取した水サンプル中の精神菌。選択的寒天に接種することを使用して、精神菌を分離することはできませんでした。ここに示されている方法には、低レベルのFLを検出する可能性があります。魚の組織および水サンプルにおける精神菌、およびこの技術は、FLの疫学を理解するための有用なツールになる可能性があります。精神菌。
レインボートラウトフライ症候群とフラボバクテリウム精神菌によって引き起こされる冷水疾患は、養殖サケ科の重要な病気です。FLの検出のために現在利用可能な手法のいくつか。精神菌は時間がかかるか、十分な感度を欠いています。現在の調査では、FLの検出の可能性。魚の組織および水サンプルからの精神菌は、16S RRNA遺伝子の配列に対してDNAプローブを備えたネストされたPCRを使用して調べました。DNAは、Chelex(R)100キレート樹脂を使用して抽出されました。病気の魚、健康な魚、養魚場の環境、参照株から分離された株に対してテストされたプライマーは、FLに特異的であることが証明されました。精神菌。flの取得された検出限界。レインボートラウトの脳組織に播種された精神菌は、PCRチューブで0.4 CFUであり、17 CFU MG-1脳組織に対応していました。PCRアッセイは、FLを注入した虹のマスの脳からの組織サンプルの寒天培養よりも敏感であることが証明されました。精神菌。flを播種した非滅菌淡水で。Psychrophilum PCRアッセイの検出限界は、PCRチューブで1.7 CFUであり、110 CFU ML-1水に対応していました。PCRアッセイはFLを検出しました。レインボートラウト農場から採取した水サンプル中の精神菌。選択的寒天に接種することを使用して、精神菌を分離することはできませんでした。ここに示されている方法には、低レベルのFLを検出する可能性があります。魚の組織および水サンプルにおける精神菌、およびこの技術は、FLの疫学を理解するための有用なツールになる可能性があります。精神菌。
Rainbow trout fry syndrome and cold-water disease, caused by Flavobacterium psychrophilum, are important diseases in farmed salmonids. Some of the presently available techniques for the detection of Fl. psychrophilum are either time consuming or lack sufficient sensitivity. In the present investigation, the possible detection of Fl. psychrophilum from fish tissue and water samples was examined using nested PCR with DNA probes against a sequence of the 16S rRNA genes. The DNA was extracted using Chelex(R) 100 chelating resin. The primers, which were tested against strains isolated from diseased fish, healthy fish, fish farm environments and reference strains, proved to be specific for Fl. psychrophilum. The obtained detection limit of Fl. psychrophilum seeded into rainbow trout brain tissue was 0.4 cfu in the PCR tube, corresponding to 17 cfu mg-1 brain tissue. The PCR-assay proved to be more sensitive than agar cultivation of tissue samples from the brain of rainbow trout injected with Fl. psychrophilum. In non-sterile fresh water seeded with Fl. psychrophilum the detection limit of the PCR-assay was 1.7 cfu in the PCR tube, corresponding to 110 cfu ml-1 water. The PCR-assay detected Fl. psychrophilum in water samples taken from a rainbow trout farm, but Fl. psychrophilum could not be isolated using inoculation on selective agar. The method presented here has the potential to detect low levels of Fl. psychrophilum in fish tissue and in water samples, and the technique can be a useful tool for understanding the epidemiology of Fl. psychrophilum.
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