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縮退したプライマーに基づく逆PCR戦略を使用して、Lactobacillus infortarumのコールドショックタンパク質ファミリーの新しい遺伝子を識別するために使用されています。以前に報告された2つのCSPLおよびCSPP遺伝子に加えて、3番目の遺伝子であるCSPCがクローン化され、特徴付けられています。3つの遺伝子はすべて、73〜88％の同一性を持つ小さな66-アミノ酸タンパク質をコードします。比較ノーザンブロット分析により、CSPL mRNAのレベルは温度ダウンシフト後に17倍まで増加するのに対し、CSPCとCSPPのmRNAレベルは変化しないか、わずかに（約2〜3倍）増加することが示されました（約2〜3倍）。CSPL mRNAのコールド誘導は一時的であり、温度ダウンシフトの重症度の関数として時間が遅れています。3つのCSP mRNAのコールドショック挙動は、4つの無関係な非CSP遺伝子で観察されたものとは対照的であり、すべてmRNAレベルの急激な減少を示しましたが、1つのケースでは、長期にわたる冷たい曝露中の転写産物の進行性回復が続きました。3つのCSP mRNAの存在量は、最適な温度で成長中に変化することもわかった（28度C）。CSPCおよびCSPP mRNAレベルは遅延期間中に最大ですが、CSPL転写産物の存在量は後期相互相成長中に最も高くなります。3つのL.足底CSP遺伝子の微分発現は、翻訳されていない領域の配列と構造の違いに関連している可能性があります。また、コールドショックと非冷酷なショック条件の両方で、遺伝子産物が別々の特定の機能を満たすという見解も支持しています。
縮退したプライマーに基づく逆PCR戦略を使用して、Lactobacillus infortarumのコールドショックタンパク質ファミリーの新しい遺伝子を識別するために使用されています。以前に報告された2つのCSPLおよびCSPP遺伝子に加えて、3番目の遺伝子であるCSPCがクローン化され、特徴付けられています。3つの遺伝子はすべて、73〜88％の同一性を持つ小さな66-アミノ酸タンパク質をコードします。比較ノーザンブロット分析により、CSPL mRNAのレベルは温度ダウンシフト後に17倍まで増加するのに対し、CSPCとCSPPのmRNAレベルは変化しないか、わずかに（約2〜3倍）増加することが示されました（約2〜3倍）。CSPL mRNAのコールド誘導は一時的であり、温度ダウンシフトの重症度の関数として時間が遅れています。3つのCSP mRNAのコールドショック挙動は、4つの無関係な非CSP遺伝子で観察されたものとは対照的であり、すべてmRNAレベルの急激な減少を示しましたが、1つのケースでは、長期にわたる冷たい曝露中の転写産物の進行性回復が続きました。3つのCSP mRNAの存在量は、最適な温度で成長中に変化することもわかった（28度C）。CSPCおよびCSPP mRNAレベルは遅延期間中に最大ですが、CSPL転写産物の存在量は後期相互相成長中に最も高くなります。3つのL.足底CSP遺伝子の微分発現は、翻訳されていない領域の配列と構造の違いに関連している可能性があります。また、コールドショックと非冷酷なショック条件の両方で、遺伝子産物が別々の特定の機能を満たすという見解も支持しています。
An inverse PCR strategy based on degenerate primers has been used to identify new genes of the cold shock protein family in Lactobacillus plantarum. In addition to the two previously reported cspL and cspP genes, a third gene, cspC, has been cloned and characterized. All three genes encode small 66-amino-acid proteins with between 73 and 88% identity. Comparative Northern blot analyses showed that the level of cspL mRNA increases up to 17-fold after a temperature downshift, whereas the mRNA levels of cspC and cspP remain unchanged or increase only slightly (about two- to threefold). Cold induction of cspL mRNA is transient and delayed in time as a function of the severity of the temperature downshift. The cold shock behavior of the three csp mRNAs contrasts with that observed for four unrelated non-csp genes, which all showed a sharp decrease in mRNA level, followed in one case (bglH) by a progressive recovery of the transcript during prolonged cold exposure. Abundance of the three csp mRNAs was also found to vary during growth at optimal temperature (28 degrees C). cspC and cspP mRNA levels are maximal during the lag period, whereas the abundance of the cspL transcript is highest during late-exponential-phase growth. The differential expression of the three L. plantarum csp genes can be related to sequence and structural differences in their untranslated regions. It also supports the view that the gene products fulfill separate and specific functions, under both cold shock and non-cold shock conditions.
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