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Bioinformatics (Oxford, England)2000Aug01Vol.16issue(8)

信号ペプチドのテストセットを使用した信号配列予測方法の比較

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文献タイプ:
  • Comparative Study
  • Journal Article
概要
Abstract

分泌タンパク質と非分泌タンパク質を含むテストセットの作成について説明します。信号配列とその切断部位の5つの既存の予測プログラムは、このテストセットに基づいて比較されます:SPSCAN、SIGCLEAVE、SIGNALP V1.1、SIGNALP V2.0。B2-HMMおよびSIGNALP V2.0.B2-NN。

分泌タンパク質と非分泌タンパク質を含むテストセットの作成について説明します。信号配列とその切断部位の5つの既存の予測プログラムは、このテストセットに基づいて比較されます:SPSCAN、SIGCLEAVE、SIGNALP V1.1、SIGNALP V2.0。B2-HMMおよびSIGNALP V2.0.B2-NN。

We describe the creation of a test set containing secretory and non-secretory proteins. Five existing prediction programs for signal sequences and their cleavage sites are compared on the basis of this test set: SPScan, SigCleave, SignalP V1.1, SignalP V2.0. b2-HMM and SignalP V2.0.b2-NN.

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