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Virus genes2000Oct01Vol.21issue(3)

多様な地理的起源からのブタサイトメガロウイルスのDNAポリメラーゼ遺伝子座の特性評価

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

ブタサイトメガロウイルス(PCMV)は、異種移植の臓器ドナーとして使用することを目的とした豚の望ましくない病原体です。現在の研究では、PCMVの遺伝子の最初のセットを特徴付けました。ドイツの分離株から、DNAポリメラーゼ(DPOL)遺伝子座が増幅され、2つの完全なオープンリーディングフレーム(ORF)と、完全なDPOL遺伝子と糖タンパク質GB遺伝子の3'Endを含む2つの部分ORFが配列決定されました。推定されたアミノ酸配列は、ベータヘルペスウイルスのそれぞれのタンパク質、特にヒトヘルペスウイルス6および7(HHV-6および-7)のそれら(ORF 36-39)と最高のアイデンティティを示しました。系統解析では、PCMVはHHV-6およびHHV-7でクラスター化されました。これに基づいて、PCMVはBetaherpesvirinaeにしっかりと分類され、暫定的にRoseololowirus属に割り当てられました。ドイツの分離株に加えて、DPOL遺伝子は英国人と日本の株、ならびにスペインの分離株から分析されました。0.4〜1%の差は、ヌクレオチドとアミノ酸レベルで見られました。保存された地域に基づいて、ヨーロッパの4か国の血液および組織サンプルでPCMVを検出したPCRのプライマーペアが選択されました。したがって、これらはPCMVを普遍的に検出することが示された最初の核酸ベースの試験システムです。ドイツの家庭用ブタの臓器へのこれらのアッセイの適用により、PCMVの有病率が50%以上であることが明らかになりました。

ブタサイトメガロウイルス(PCMV)は、異種移植の臓器ドナーとして使用することを目的とした豚の望ましくない病原体です。現在の研究では、PCMVの遺伝子の最初のセットを特徴付けました。ドイツの分離株から、DNAポリメラーゼ(DPOL)遺伝子座が増幅され、2つの完全なオープンリーディングフレーム(ORF)と、完全なDPOL遺伝子と糖タンパク質GB遺伝子の3'Endを含む2つの部分ORFが配列決定されました。推定されたアミノ酸配列は、ベータヘルペスウイルスのそれぞれのタンパク質、特にヒトヘルペスウイルス6および7(HHV-6および-7)のそれら(ORF 36-39)と最高のアイデンティティを示しました。系統解析では、PCMVはHHV-6およびHHV-7でクラスター化されました。これに基づいて、PCMVはBetaherpesvirinaeにしっかりと分類され、暫定的にRoseololowirus属に割り当てられました。ドイツの分離株に加えて、DPOL遺伝子は英国人と日本の株、ならびにスペインの分離株から分析されました。0.4〜1%の差は、ヌクレオチドとアミノ酸レベルで見られました。保存された地域に基づいて、ヨーロッパの4か国の血液および組織サンプルでPCMVを検出したPCRのプライマーペアが選択されました。したがって、これらはPCMVを普遍的に検出することが示された最初の核酸ベースの試験システムです。ドイツの家庭用ブタの臓器へのこれらのアッセイの適用により、PCMVの有病率が50%以上であることが明らかになりました。

Porcine cytomegalovirus (PCMV) is an undesired pathogen in pigs intended for use as organ donors in xenotransplantation. In the present work, we characterized the first set of genes of PCMV. From a German isolate, the DNA polymerase (DPOL) locus was amplified and two complete open reading frames (ORF) as well as two partial ORFs including the complete DPOL gene and the 3'-end of the glycoprotein gB gene were sequenced. The deduced amino acid sequences showed the highest identities with the respective proteins of the betaherpesviruses, in particular those (ORFs 36-39) of the human herpesviruses 6 and 7 (HHV-6 and -7). In phylogenetic analysis, PCMV clustered also with HHV-6 and HHV-7. On this basis, PCMV could be firmly classified to the Betaherpesvirinae and tentatively assigned to the genus Roseolovirus. In addition to the German isolate, the DPOL gene was analysed from a British and a Japanese strain as well as a Spanish isolate. Differences of 0.4 to 1% were found on the nucleotide and the amino acid level. On the basis of the conserved regions, primer pairs were selected for PCR which detected PCMV in blood and tissue samples from four European countries. Therefore, these are the first nucleic acid-based test systems which were shown to universally detect PCMV. The application of these assays to organs of domestic pigs from Germany revealed a PCMV prevalence of > 50%.

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