HMGICのイントロン4内の異常なスプライシングにつながる染色体再配列？

染色体再構成による高移動度グループタンパク質遺伝子 HMGIC と他の遺伝子との融合は、さまざまなヒトの良性腫瘍で発生します。明らかに他の染色体に由来する遺伝子とは対照的に、HMGIC に融合された異所性配列の一部は、CASH (体細胞ハイブリッドを使用した染色体割り当て) 分析によって 12 番染色体に割り当てられており、選択的スプライシングの結果であるか、または真の染色体を表すと推測できます。12番染色体上の他の遺伝子に由来する異所性配列。このエクソンに融合した異所性配列を同定する試みとして、我々はイントロン4全体の配列を決定した。異なる腫瘍においてHMGICのエクソン4に融合していることが以前に報告されていた7つの異所性配列のうち4つが、遺伝子のイントロン 4 内に位置し、異常なスプライシングによるものであることが判明しました。この観察を説明するメカニズムとしては、HMGIC を直接破壊しない染色体異常のブレークポイントがその付近で小さなゲノム変化を誘発し、それによって異常なスプライシングを促進する可能性があることが示唆されます。後者のメカニズムは、12q14--15 の再構成を特徴とする新生物の一部の発生の根底にある可能性があります。

Fusion of the high-mobility group protein gene HMGIC to other genes due to chromosomal rearrangements occurs in a variety of human benign tumors. In contrast to genes clearly derived from other chromosomes, some of the ectopic sequences fused to HMGIC have been assigned to chromosome 12 by CASH (chromosome assignment using somatic cell hybrids) analyses and thus can be assumed either to result from alternative splicing or to represent true ectopic sequences derived from other genes on chromosome 12. In an attempt to identify the ectopic sequences fused to this exon, we have sequenced the entire intron 4. Four of seven ectopic sequences previously described to be fused to exon 4 of HMGIC in different tumors were found to be located within intron 4 of the gene and thus are due to abnormal splicing. As for a mechanism explaining this observation, it can be suggested that breakpoints of chromosomal aberrations not directly disrupting HMGIC may induce small genomic alterations in their vicinity and thus facilitate abnormal splicing. The latter mechanism may underlie the development of part of the neoplasms characterized by 12q14--15 rearrangements.