転写因子Rhoは、RNA上のRNA-DNAヘリカーゼとして作用するために自由端を必要としません

Escherichia coli rho因子は、初期のRNA転写産物との相互作用を介してRNAの合成を終了するリング型の同性愛者タンパク質です。その作用メカニズムには、リング構造の穴を介したRNA転写産物の移行が含まれる可能性があるため、その作用は、遊離5 '末端の可用性に依存する可能性があります。Rhoの活性が5'エンド依存性であるかどうかを判断するために、Lambda CroMRNAの円形誘導体に結合して機能する能力が調査されました。円形誘導体は、3'Endの近くにある配列を相補的である5'末端の近くに余分な10ヌクレオチド配列を含むラムダクロRNAの誘導体に対するRNAリガーゼの作用によりin vitroで作成されました。rhoは、標準のCRO転写産物と同じくらい円形誘導体RNAにほぼ密接に結合しました。Rhoはまた、ATP依存反応で円形RNAとのらせん状の複合体からDNAオリゴヌクレオチドを容易に解離することができました。したがって、転写産物に対するRhoの作用は、無料の5 '末端の可用性に依存しません。

Escherichia coli Rho factor is a ring-shaped, homohexameric protein that terminates synthesis of RNA through interactions with the nascent RNA transcript. Because its mechanism of action may involve translocation of the RNA transcript through the hole in its ring structure, its action could depend on the availability of a free 5' terminus. To determine whether Rho's activity is 5'-end-dependent, its ability to bind to and function on a circular derivative of lambda cro mRNA was investigated. The circular derivative was made in vitro by action of RNA ligase on a derivative of lambda cro RNA containing an extra 10-nucleotide sequence near the 5'-end that was complementary to a sequence located near the 3'-end. Rho bound nearly as tightly to the circular derivative RNA as to the standard cro transcript. Rho was also able to readily dissociate a DNA oligonucleotide from its helical complex with the circular RNA in an ATP-dependent reaction. Thus, the action of Rho on a transcript does not depend on the availability of a free 5' terminus.