ショウジョウバエのアフリカ人集団のより多くの珍しいバリエーションを港の上の下交差点の地域

多様性レベルと組換え速度の間の相関は、有利な突然変異の迅速な固定に関連するヒッチハイクなどのポジティブ選択のモデルと、強く有害な突然変異に対する選択の精製モデルの両方によって予測されます（一般に「バックグラウンド選択」と呼ばれます）。ショウジョウバエ集団に適したパラメーター値を使用すると、モデルの最初のクラスのみが、ニュートラルモデルと比較して、リンクされたニュートラルバリアントの周波数スペクトルに顕著なスキューを予測します。ここでは、ショウジョウバエのメラノガスターゲノム全体に散在する29個の遺伝子座を考慮します。アフリカの個体群では、多型変異の周波数スペクトルの要約が、交差する減数分裂速度と正の相関があることを示しています。このパターンは、バックグラウンド選択のモデルではありそうもないことが実証されています。弱く有害な選択のモデルは、観察された相関と、低（ただしゼロではない）組換えの領域でヌクレオチドの多様性が減少する程度の両方を生成するとは期待されていません。したがって、既存のモデルのうち、有利なバリアントの再発性の固定によるヒッチハイクは、データの最ももっともらしい説明です。

A correlation between diversity levels and rates of recombination is predicted both by models of positive selection, such as hitchhiking associated with the rapid fixation of advantageous mutations, and by models of purifying selection against strongly deleterious mutations (commonly referred to as "background selection"). With parameter values appropriate for Drosophila populations, only the first class of models predicts a marked skew in the frequency spectrum of linked neutral variants, relative to a neutral model. Here, we consider 29 loci scattered throughout the Drosophila melanogaster genome. We show that, in African populations, a summary of the frequency spectrum of polymorphic mutations is positively correlated with the meiotic rate of crossing over. This pattern is demonstrated to be unlikely under a model of background selection. Models of weakly deleterious selection are not expected to produce both the observed correlation and the extent to which nucleotide diversity is reduced in regions of low (but nonzero) recombination. Thus, of existing models, hitchhiking due to the recurrent fixation of advantageous variants is the most plausible explanation for the data.