X線結晶解析用のセレン誘導体化ヌクレオシドおよびオリゴヌクレオチドの合成

我々はここで、ヌクレオチドX線結晶構造解析においてMAD相決定を可能にする異常散乱中心として機能するセレンを含むヌクレオシドおよびオリゴヌクレオチド類似体の合成を報告する。我々は、A、C、G、T、U ヌクレオシドの 5' 位にセレン官能基を導入する相転移アプローチを開発しました。セレン官能基の導入では、脱離基 (臭化物、メシル、トシル) がセレン化ナトリウム、二セレン化ナトリウム、メチルセレン化ナトリウムで容易に置換され、収率は 90% 以上でした。セレン誘導体化オリゴヌクレオチドは、ホスホラミダイト化学を介して合成されています。

We report here the synthesis of nucleoside and oligonucleotide analogs containing selenium, which serves as an anomalous scattering center to enable MAD phase determination in nucleotide X-ray crystallography. We have developed a phase transfer approach to introduce the selenium functionality in A, C, G, T, and U nucleosides at 5'-positions. In the incorporation of the selenium functionality, the leaving groups (bromide, mesyl, and tosyl) were readily displaced by sodium selenide, sodium diselenide, and sodium methyl selenide with yields higher than 90%. Selenium-derivatized oligonucleotides have been synthesized via phosphoramidite chemistry.