Saccharomycesゲノムデータベース（SGD）は、遺伝子オントロジー（GO）を使用して二次遺伝子注釈を提供します

Saccharomycesゲノムデータベース（SGD）リソースは、遺伝的および物理的マップからゲノム全体の分析ツールに至るまで、過去10年間の遺伝子とその機能を特定する科学的進歩を反映しています。強調が遺伝子の同定から細胞内の遺伝子産物の役割の特定に移行するにつれて、SGDは、Saccharomyces cerevisiae内および種を超えて、遺伝子産物間で関係を可能にする注釈をユーザーに提供しようとしています。この目的のために、SGDは遺伝子に遺伝子オントロジー（GO）に注釈を付けています。これは、種間で共有できる生物学的知識の構造化された表現です。GOは、分子機能、生物学的プロセス、細胞成分を記述する3つの別々のオントロジーで構成されています。目標は、公開された情報を使用して、特徴づけられた各S.cerevisiae遺伝子産物を3つのオントロジーのそれぞれから1つ以上のGO用語に関連付けることです。役立つには、実験的証拠、必要に応じて修正された修正、および与えられた引用の証拠コードを介した注釈の慎重な文書に基づいて正確な関連性を可能にする方法で行う必要があります。この目標を達成することは、SGDで進行中のプロセスです。SGDおよびその他の参加データベースでのGOアノテーションの現在の進捗状況、および3つのオントロジーのそれぞれの説明については、http：//www.geneontology.orgのGOコンソーシアムページをご覧ください。SGD遺伝子関連は、http：//genome-www.stanford.edu/saccharomyces/のサイトにアクセスすることで見つけることができます。

The Saccharomyces Genome Database (SGD) resources, ranging from genetic and physical maps to genome-wide analysis tools, reflect the scientific progress in identifying genes and their functions over the last decade. As emphasis shifts from identification of the genes to identification of the role of their gene products in the cell, SGD seeks to provide its users with annotations that will allow relationships to be made between gene products, both within Saccharomyces cerevisiae and across species. To this end, SGD is annotating genes to the Gene Ontology (GO), a structured representation of biological knowledge that can be shared across species. The GO consists of three separate ontologies describing molecular function, biological process and cellular component. The goal is to use published information to associate each characterized S.cerevisiae gene product with one or more GO terms from each of the three ontologies. To be useful, this must be done in a manner that allows accurate associations based on experimental evidence, modifications to GO when necessary, and careful documentation of the annotations through evidence codes for given citations. Reaching this goal is an ongoing process at SGD. For information on the current progress of GO annotations at SGD and other participating databases, as well as a description of each of the three ontologies, please visit the GO Consortium page at http://www.geneontology.org. SGD gene associations to GO can be found by visiting our site at http://genome-www.stanford.edu/Saccharomyces/.