非ホジキンリンパ腫細胞株の分子細胞遺伝学的特性評価

スペクトル核型化（空）および比較ゲノムハイブリダイゼーション（CGH）は、細胞遺伝学的分析の解決を大幅に強化し、腫瘍細胞の再編成と増幅の新規領域の同定を可能にします。ここでは、オンタリオがん研究所（OCI）で由来する10の悪性非ホジキンリンパ腫（NHL）細胞株の分析を報告します。、OCI-Ly8、OCI-Ly12、OCI-Ly13.2、OCI-Ly17、およびOCI-Ly18、G-Banding、Sky、およびCGHによると、包括的な細胞遺伝学的プロファイルを提示します。Gバンディングによって特定された52のブレークポイントとは対照的に、Skyは87のブレークポイントを特定しました。これは、1Q21、7p15、8p11、13q21、13q32、14q32、17q11、および18q21でクラスター化されました。Gバンディングは、以前に記載された再発転座、t（8; 14）（q24; q32）およびt（14; 18）（q32; q21）を含む10の転座を特定しました。対照的に、Skyは、繰り返し発生した5つを含む60の転座を特定しました、t（8; 14）（q24; q32）、t（14; 18）（q32; q21）、t（4; 7）（p12; q22）、t（11; 18）（q22; q21）、およびt（3; 18）（q21; p11）。スカイはまた、すべてのマーカー染色体のソースを特定しました。さらに、Gバンディングによって正常に分類された10個の染色体が、スカイによって再配置されることが判明しました。CGHは、高レベルDNA増幅の7つの部位、1Q31-32、2P12-16、8Q24、11q23-25、13Q21-22、13q32-34、および18Q21-23を特定しました。これらのうち、1q31-32、11q23-25、13q21-22、および13q32-34は、以前はNHLで増幅されていないと説明されていませんでした。10 NHL細胞株のこの包括的な細胞遺伝学的特性は、再配列と増幅の新規部位を特定しました。また、遺伝子発見と遺伝子機能を対象とした実験研究での価値を高めます。

Spectral karyotyping (SKY) and comparative genomic hybridization (CGH) have greatly enhanced the resolution of cytogenetic analysis, enabling the identification of novel regions of rearrangement and amplification in tumor cells. Here we report the analysis of 10 malignant non-Hodgkin lymphoma (NHL) cell lines derived at the Ontario Cancer Institute (OCI), Toronto, designated as OCI-Ly1, OCI-Ly2, OCI-Ly3, OCI-LY4, OCI-Ly7, OCI-Ly8, OCI-Ly12, OCI-Ly13.2, OCI-Ly17, and OCI-Ly18, by G-banding, SKY, and CGH, and we present their comprehensive cytogenetic profiles. In contrast to the 52 breakpoints identified by G-banding, SKY identified 87 breakpoints, which clustered at 1q21, 7p15, 8p11, 13q21, 13q32, 14q32, 17q11, and 18q21. G-banding identified 10 translocations, including the previously described recurring translocations, t(8;14)(q24;q32) and t(14;18)(q32;q21). In contrast, SKY identified 60 translocations, including five that were recurring, t(8;14)(q24;q32), t(14;18)(q32;q21), t(4;7)(p12;q22), t(11;18)(q22;q21), and t(3;18)(q21;p11). SKY also identified the source of all the marker chromosomes. In addition, 10 chromosomes that were classified as normal by G-banding were found by SKY to be rearranged. CGH identified seven sites of high-level DNA amplification, 1q31-32, 2p12-16, 8q24, 11q23-25, 13q21-22, 13q32-34, and 18q21-23; of these, 1q31-32, 11q23-25, 13q21-22, and 13q32-34 have previously not been described as amplified in NHL. This comprehensive cytogenetic characterization of 10 NHL cell lines identified novel sites of rearrangement and amplification; it also enhances their value in experimental studies aimed at gene discovery and gene function.