Weissella confusaの分類学的研究とWeissella Cibaria sp novの説明、食品および臨床サンプルで検出された

ワセラ属に属する2つの細菌集団の関係を明確にするために、分類学的研究が実施されました。主にマレーシアの食品（22株）と人間（9株）および動物（6株）からの臨床サンプルから生まれた合計39株を、多発性分類学的アプローチを使用して分析しました。この方法には、古典的な表現型、全細胞タンパク質電気泳動、16Sおよび23S RDNA RFLP（リボタイピング）、16S RDNA配列ホモロジーの測定、DNA-DNA再配置レベルの測定が含まれていました。結果に基づいて、株は2つの異なる種、ワセラconfusaと新しいワセラ種を表すと考えられていました。11月。提案されています。Weisella Confusaは、Weisella Cibariaと最高の16S RDNA配列の類似性を持っていましたが、DNA-DNAの再分類実験では、研究された株の間で49％未満のハイブリダイゼーションレベルが示されました。Weisella confusaおよびWeisella Cibaria株の数値分析では、株の起源に関する特定のクラスタリングは明らかになりませんでした。全細胞タンパク質の電気泳動、およびCLAIおよびHINDIIIリボタイピングパターンに基づいて、食物および臨床分離株は、得られた2つの種特異的なクラスターにランダムに配置されました。

A taxonomic study was conducted to clarify the relationships of two bacterial populations belonging to the genus Weissella. A total of 39 strains originating mainly from Malaysian foods (22 strains) and clinical samples from humans (9 strains) and animals (6 strains) were analysed using a polyphasic taxonomic approach. The methods included classical phenotyping, whole-cell protein electrophoresis, 16S and 23S rDNA RFLP (ribotyping), determination of 16S rDNA sequence homologies and DNA-DNA reassociation levels. Based on the results, the strains were considered to represent two different species, Weissella confusa and a novel Weissella species, for which the name Weissella cibaria sp. nov. is proposed. Weisella confusa possessed the highest 16S rDNA sequence similarity to Weisella cibaria, but the DNA-DNA reassociation experiment showed hybridization levels below 49% between the strains studied. The numerical analyses of Weisella confusa and Weisella cibaria strains did not reveal any specific clustering with respect to the origin of the strains. Based on whole-cell protein electrophoresis, and ClaI and HindIII ribotyping patterns, food and clinical isolates were randomly located in the two species-specific clusters obtained.