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Biopolymers20020101Vol.67issue(4-5)

循環二色性分光法は、DNAにおけるグアニン走行の不変の立体構造を明らかにします

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

D(G4)の平行鎖DNAテトラプレックス、特に260 nmの強力なバンドの特徴的な循環二色性(CD)の特徴は、d(c4g4)のbおよびaの形態の特徴であることを実証します。したがって、このバンドは明らかにトラストランドのグアニンガニン積み重ねに由来するため、二重鎖および四肢DNAで非常に類似しています。さらに、同じタイプのCDスペクトルが、D(GA)10の順序付けられた単一鎖によって提供されます。この観察結果は、D(GA)10の順序付けられた単一鎖が、平行テトラプルのように積み重ねられたグアニンのコアによって安定化されることを示唆しています。このビューは、順序付きD(GA)10単鎖の分子構造のモデリングを開始するために使用されます。私たちの研究は、グアニン自体がDNAのさまざまな二次構造を安定させるのに十分な強さであることを示唆しています。これは、分子レプリケーターの起源と進化について考えることに関連する特性です。

D(G4)の平行鎖DNAテトラプレックス、特に260 nmの強力なバンドの特徴的な循環二色性(CD)の特徴は、d(c4g4)のbおよびaの形態の特徴であることを実証します。したがって、このバンドは明らかにトラストランドのグアニンガニン積み重ねに由来するため、二重鎖および四肢DNAで非常に類似しています。さらに、同じタイプのCDスペクトルが、D(GA)10の順序付けられた単一鎖によって提供されます。この観察結果は、D(GA)10の順序付けられた単一鎖が、平行テトラプルのように積み重ねられたグアニンのコアによって安定化されることを示唆しています。このビューは、順序付きD(GA)10単鎖の分子構造のモデリングを開始するために使用されます。私たちの研究は、グアニン自体がDNAのさまざまな二次構造を安定させるのに十分な強さであることを示唆しています。これは、分子レプリケーターの起源と進化について考えることに関連する特性です。

We demonstrate that the characteristic circular dichroism (CD) features of the parallel-stranded DNA tetraplex of d(G4), especially the strong band at 260 nm, are characteristic for the B and A forms of the antiparallel duplex of d(C4G4). Hence, this band evidently originates from intrastrand guanine-guanine stacking, which is therefore very similar in the duplex and tetraplex DNA. In addition, the same type of the CD spectrum is provided by the ordered single strand of d(GA)10. This observation suggests that the ordered single strand of d(GA)10 is stabilized by a core of guanines stacked like in the parallel tetraplex. This view is used to start the modeling of the molecular structure of the ordered d(GA)10 single strand. Our studies suggest that guanine itself is strong enough to stabilize various secondary structures of DNA, which is a property relevant to thinking about the origin and evolution of molecular replicators.

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