魚の代替エクソンの異なる変性に関連する重複するMITF遺伝子のサブ機能化

腫瘍性関連転写因子（MITF）は、少なくとも4つのアイソフォームに存在します。これらは、単一の遺伝子からの代替5 'エクソンとプロモーターを使用して、高等脊椎動物で生成されます。ただし、2つの別々の遺伝子（MITF-MとMITF-B）は、Poeciliid Xiphophorus、Pufferfishes Fugu Rubripes、Tetraodon nigroviridis、ゼブラフィッシュのダニオレリオなど、異なる硬骨魚魚種に存在​​します。魚タンパク質MITF-MおよびMITF-Bは、構造レベルと発現レベルの両方で、特定の鳥/哺乳類MITFアイソフォームに対応します。少なくとも1億年前の重複後のMITF遺伝子の硬骨魚系統のサブ機能化は、代替エクソン、おそらく調節要素とプロモーターの変性と関連しています。たとえば、MITF-Mに固有の最初のエクソンの残骸は、MITF-Bをコードするフイフフィッシュ遺伝子内で検出されます。脊椎動物におけるMITF遺伝子の進化の歴史をたどると、硬骨魚または鳥/哺乳類の系統に固有の新しいイントロンの微分動員が明らかになりました。

The microphthalmia-associated transcription factor (MITF) exists in at least four isoforms. These are generated in higher vertebrates using alternative 5' exons and promoters from a single gene. Two separate genes (mitf-m and mitf-b), however, are present in different teleost fish species including the poeciliid Xiphophorus, the pufferfishes Fugu rubripes and Tetraodon nigroviridis, and the zebrafish Danio rerio. Fish proteins MITF-m and MITF-b correspond at both the structural and the expression levels to one particular bird/mammalian MITF isoform. In the teleost lineage subfunctionalization of mitf genes after duplication at least 100 million years ago is associated with the degeneration of alternative exons and, probably, regulatory elements and promoters. For example, a remnant of the first exon specific for MITF-m is detected within the pufferfish gene encoding MITF-b. Retracing the evolutionary history of mitf genes in vertebrates uncovered the differential recruitment of new introns specific for either the teleost or the bird/mammalian lineage.