リボソームでのデコード中のリボソームRNAの構造ダイナミクス

デコードは、リボソームがAサイトのmRNAコドンに一致するアミノアシルTRNA（AA-TRNA）を正確に選択する多段階プロセスです。コドン・アンチョドン複合体の正しいジオメトリはリボソームによって監視され、誘導フィットメカニズムによって小（30S）リボソームサブユニットのデコード中心に立体構造の変化をもたらします。AA-TRNAの認識は、後者のアーキテクチャに影響を与えるか、GTPaseおよびペプチジルトランスフェラーゼ中心が配置されている大きな（50S）サブユニットと30年代サブユニットの通信に影響を与える可能性のあるデコードセンター以外の領域のリボソーム立体構造の変化によって調節されます。正しいコドン - 依存症の複合体形成は、GTP加水分解とペプチド結合形成の速度を大きく加速し、サブユニットとAA-TRNA選択における50年代サブユニットの役割の間のクロストークの重要性を示しています。現在のレビューでは、リボソーム結晶学の最近の結果、クレオエレクトロン顕微鏡（CRYO-EM）、遺伝学、急速な速度論、および生化学的アプローチがレビューされ、リボソームRNA（RRNA）の構造のダイナミクスがデコードに重要な役割を果たすことを示しています。

Decoding is a multistep process by which the ribosome accurately selects aminoacyl-tRNA (aa-tRNA) that matches the mRNA codon in the A site. The correct geometry of the codon-anticodon complex is monitored by the ribosome, resulting in conformational changes in the decoding center of the small (30S) ribosomal subunit by an induced-fit mechanism. The recognition of aa-tRNA is modulated by changes of the ribosome conformation in regions other than the decoding center that may either affect the architecture of the latter or alter the communication of the 30S subunit with the large (50S) subunit where the GTPase and peptidyl transferase centers are located. Correct codon-anticodon complex formation greatly accelerates the rates of GTP hydrolysis and peptide bond formation, indicating the importance of crosstalk between the subunits and the role of the 50S subunit in aa-tRNA selection. In the present review, recent results of the ribosome crystallography, cryoelectron microscopy (cryo-EM), genetics, rapid kinetics and biochemical approaches are reviewed which show that the dynamics of the structure of ribosomal RNA (rRNA) play a crucial role in decoding.