バットマンはPolycombおよびTrithoraxグループの遺伝子と相互作用し、Gaga因子を含む複合体に含まれるBTB/POZタンパク質をコードします

PolycombおよびTrithoraxグループの遺伝子は、ショウジョウバエのメラノガスターの発達全体で、適切な抑制または活性化されたホメオティック遺伝子発現の状態を維持しています。バットマン遺伝子は、性的櫛の抑制に必要であるため、その機能が減少するために必要であるため、バットマン遺伝子をポリコムグループ候補として特定しました。しかし、現在の遺伝子分析は、ホメオティック遺伝子の活性化と抑制の両方におけるバットマンの機能を示しています。127アミノ酸バットマンタンパク質は、大規模なタンパク質ファミリーで見られる進化的保存タンパク質間相互作用ドメインであるBTB/POZドメインにほぼ縮小されています。このドメインは、バットマンとTrithorax様遺伝子によってコードされるDNA結合GAGA因子の相互作用に関与していることを示します。ポリテン染色体に関するガガ因子とバットマンのコードストリブは、核胚と幼虫の抽出物からの共免疫沈降、および酵母2ハイブリッドアッセイで相互作用します。バットマンは、ガガ因子とともに、ビトホラキソイドポリコム応答要素の70 bpフラグメントであるMHS-70に結合します。この結合は、ガガ因子と同様に、d（ga）n配列の存在を必要とします。一緒に、我々の結果は、バットマンがトリソラックス様を含む遺伝子のポリコム/トリトラックスグループのサブセットに属していることを示唆しています。

Polycomb and trithorax group genes maintain the appropriate repressed or activated state of homeotic gene expression throughout Drosophila melanogaster development. We have previously identified the batman gene as a Polycomb group candidate since its function is necessary for the repression of Sex combs reduced. However, our present genetic analysis indicates functions of batman in both activation and repression of homeotic genes. The 127-amino-acid Batman protein is almost reduced to a BTB/POZ domain, an evolutionary conserved protein-protein interaction domain found in a large protein family. We show that this domain is involved in the interaction between Batman and the DNA binding GAGA factor encoded by the Trithorax-like gene. The GAGA factor and Batman codistribute on polytene chromosomes, coimmunoprecipitate from nuclear embryonic and larval extracts, and interact in the yeast two-hybrid assay. Batman, together with the GAGA factor, binds to MHS-70, a 70-bp fragment of the bithoraxoid Polycomb response element. This binding, like that of the GAGA factor, requires the presence of d(GA)n sequences. Together, our results suggest that batman belongs to a subset of the Polycomb/trithorax group of genes that includes Trithorax-like, whose products are involved in both activation and repression of homeotic genes.