転写活性サブ遺伝子プロモーターは、プラス鎖RNAウイルスの相同クロスオーバーをサポートします

遺伝的RNA組換えは、ウイルスの進化において重要な役割を果たしますが、その分子メカニズムはよく理解されていません。この研究では、三アルティットプラス鎖RNAウイルスであるブロムモザイクブロモウイルス（BMV）のRNA3セグメントのサブ遺伝子プロモーター（SGP）領域によってサポートされる相同RNA組換え活動について説明します。クロスオーバー周波数は、マーカー制限部位が挟まれた重複したSGP領域を運ぶBMV RNA3バリアントのペアを含む共同化により決定されました。SGPコア、ポリ（a）路、および上流のエンハンサーで構成される領域は、分析されたRNA3子孫の25％で相同交換をサポートしました。しかし、SGPコアの変異は、SGP RNAの転写と相同組換えの両方を止めました。これらのデータは、RNA組換えと転写との関連の証拠を提供します。

Genetic RNA recombination plays an important role in viral evolution, but its molecular mechanism is not well understood. In this work we describe homologous RNA recombination activity that is supported by a subgenomic promoter (sgp) region in the RNA3 segment of brome mosaic bromovirus (BMV), a tripartite plus-strand RNA virus. The crossover frequencies were determined by coinoculations with pairs of BMV RNA3 variants that carried a duplicated sgp region flanked by marker restriction sites. A region composed of the sgp core, a poly(A) tract, and an upstream enhancer supported homologous exchanges in 25% of the analyzed RNA3 progeny. However, mutations in the sgp core stopped both the transcription of the sgp RNA and homologous recombination. These data provide evidence for an association of RNA recombination with transcription.