GYRB遺伝子配列に基づくaeromonas属のメンバーの系統解析

Aeromonas属のすべての既知の種の系統発生関係は、DNA GyraseのBサブユニットをコードする遺伝子であるGyrbの配列を使用して調査されました。Gyrbのヌクレオチド配列は、16S RDNA変数領域の分析によっても特徴付けられたいくつかの新しい分離株を含む53のアエロモナス株から決定されました。この結果は、Plesiomonas shigelloidesおよび他の腸内細菌とは異なるものとして、アエロモナ科科の認識を支持しています。この系統発生マーカーは、これまでに説明されているすべてのエアロモナス種の分類学的組織と一致するひずみグループを明らかにしました。特に、GYRBの結果は16S RDNA分析と一致しました。さらに、前者は種を区別する能力が高いことを示しました。現在の分析は、異なるDNA-DNAハイブリダイゼーションセット間の報告された矛盾の解明に役立ちました。さらに、種内レベルで見られるシーケンスの多様性により、GYRBは種と株の同時識別の有用なターゲットとして提案されています。結論として、GYRB遺伝子は、aeromonas属の系統学的研究の優れた分子クロノメーターであることが証明されています。

The phylogenetic relationships of all known species of the genus Aeromonas were investigated by using the sequence of gyrB, a gene that encodes the B-subunit of DNA gyrase. Nucleotide sequences of gyrB were determined from 53 Aeromonas strains, including some new isolates, which were also characterized by analysis of the 16S rDNA variable regions. The results support the recognition of the family Aeromonadaceae, as distinct from Plesiomonas shigelloides and other enteric bacteria. This phylogenetic marker revealed strain groupings that are consistent with the taxonomic organization of all Aeromonas species described to date. In particular, gyrB results agreed with 16S rDNA analysis; moreover, the former showed a higher capacity to differentiate between species. The present analysis was useful for the elucidation of reported discrepancies between different DNA-DNA hybridization sets. Additionally, due to the sequence diversity found at the intraspecies level, gyrB is proposed as a useful target for simultaneous identification of species and strains. In conclusion, the gyrB gene has proved to be an excellent molecular chronometer for phylogenetic studies of the genus Aeromonas.