ヒトアンドロゲン受容体遺伝子の多型CAGリピート近くのHPAIIおよびHHAI部位のメチル化は、X染色体不活性化と相関しています

ヒトアンドロゲン受容体遺伝子（Humara; Genbank）には、最初のエクソンに非常に多型トリヌクレオチド繰り返しが含まれています。この多型短いタンデムリピート（STR）から100 bp未満のHPAIIおよびHHAIのメチル化は、Xの不活性化と相関することがわかりました。制限酵素部位がSTRに近接しているため、母体と父親の対立遺伝子を区別し、メチル化状態を特定するPCRアッセイの開発が可能になります。このアッセイの精度は、活性または不活性のヒトX染色体を含むハムスター/ヒトハイブリッド細胞株の（a）DNAでテストされました。（b）正常な男性と女性からのDNA。（c）Xの不活性化の非ランダムパターンを示す女性のDNA。このアッセイを使用して得られたデータは、サザンブロット分析によってXの不活性化パターンを検出するPGK、HPRT、およびM27ベータプローブを使用して得られたものと実質的に相関していました。このアッセイの1つの用途を実証するために、X連鎖アガンマグロブリン血症の潜在的および必須キャリアのBリンパ球のX不活性化パターンを調べました。

The human androgen-receptor gene (HUMARA; GenBank) contains a highly polymorphic trinucleotide repeat in the first exon. We have found that the methylation of HpaII and HhaI sites less than 100 bp away from this polymorphic short tandem repeat (STR) correlates with X inactivation. The close proximity of the restriction-enzyme sites to the STR allows the development of a PCR assay that distinguishes between the maternal and paternal alleles and identifies their methylation status. The accuracy of this assay was tested on (a) DNA from hamster/human hybrid cell lines containing either an active or inactive human X chromosome; (b) DNA from normal males and females; and (c) DNA from females showing nonrandom patterns of X inactivation. Data obtained using this assay correlated substantially with those obtained using the PGK, HPRT, and M27 beta probes, which detect X inactivation patterns by Southern blot analysis. In order to demonstrate one application of this assay, we examined X inactivation patterns in the B lymphocytes of potential and obligate carriers of X-linked agammaglobulinemia.