チンパンジーとボノボのヌクレオチドの多様性が低い

ヒトと類人猿のヌクレオチド多様性のレベルの比較は、DNA多型の維持メカニズムとこれらの生物の人口統計史について多くの洞察を提供する可能性があります。過去において、豊富なミトコンドリアDNA（mtDNA）多型データは、ヌクレオチドの多様性（PI）がヒトよりもチンパンゼの方が3倍以上高いことを示しています。さらに、最近、限られたデータに基づいて、これは核DNAにも当てはまると主張されています。この研究では、9つのボノボと17のチンパンジーの核ゲノムからランダムに選択された50の非コード、非繰り返しDNAセグメントを配列決定しました。驚くべきことに、ボノボのPI値はわずか0.078％であり、同じ50セグメントの人間の（0.088％）よりもやや低いです。PI値は、東アフリカ、中央、および西アフリカのチンパンジーでそれぞれ0.092、0.130、および0.082％、およびすべてのチンパンジーで0.132％です。これらの値は、人間の値よりも最大1.5倍しか類似していません。人間とチンパンジーの間の核DNA多様性よりもmtDNA多様性のはるかに大きな違いは不可解です。n（e）の減少は、核DNAの多様性よりもmtDNA多様性に強い影響を与えるため、ヒトとチンパンジーの発散後のヒト系統の有効な人口サイズ（n（e））の減少によるものであると推測します。この記事のシーケンスデータは、アクセッションNOSの下でGenBankデータライブラリに預けられています。ay 275957-yay 277244。

Comparison of the levels of nucleotide diversity in humans and apes may provide much insight into the mechanisms of maintenance of DNA polymorphism and the demographic history of these organisms. In the past, abundant mitochondrial DNA (mtDNA) polymorphism data indicated that nucleotide diversity (pi) is more than threefold higher in chimpanzees than in humans. Furthermore, it has recently been claimed, on the basis of limited data, that this is also true for nuclear DNA. In this study we sequenced 50 noncoding, nonrepetitive DNA segments randomly chosen from the nuclear genome in 9 bonobos and 17 chimpanzees. Surprisingly, the pi value for bonobos is only 0.078%, even somewhat lower than that (0.088%) for humans for the same 50 segments. The pi values are 0.092, 0.130, and 0.082% for East, Central, and West African chimpanzees, respectively, and 0.132% for all chimpanzees. These values are similar to or at most only 1.5 times higher than that for humans. The much larger difference in mtDNA diversity than in nuclear DNA diversity between humans and chimpanzees is puzzling. We speculate that it is due mainly to a reduction in effective population size (N(e)) in the human lineage after the human-chimpanzee divergence, because a reduction in N(e) has a stronger effect on mtDNA diversity than on nuclear DNA diversity. Sequence data from this article have been deposited with the GenBank Data libraries under accession nos. AY 275957-AY 277244.