ガフキカホマリにおけるペプチドグリカンの生合成ペプチドグリカンの細胞壁への取り込みとトランスペプチドの方向

ガフキアホマリからの壁膜酵素製剤は、前駆体ペアからのペプチドグリカンの形成を触媒します：UDP-N-アセチルグルコサミン + UDP-N-アセチルムルミル - ペンタペプチド（UDP-Murnac-Ala-dglu-Lys-dala）およびUDP-からもまた、N-アセチルグルコサミン +UDP-N-アセチルムラミル - テトラペプチド（UDP-Murnac-Ala-Dglu-Lys-dala）。反応産物の一部は2％ドデシル筋骨動物に溶けますが、他の部分は既存の細胞壁ペプチドグリカンに結合しています。細胞壁への取り込みは、既存の細胞壁におけるD-アラニル-D-アラニン配列がドナーとして機能し、新しく合成されたペプチドグリカン鎖関数として機能して機能しているリジンアミノ基のリジロンアミノ基が機能するトランスペプチド反応によってもたらされます。アクセプター。Nepsilon-D-アラニル - リジンの結合が形成されます。UDP-N-アセチルグルコサミンの飽和濃度で、酵素系は、UDP-Murnac-ペンタペプチドとUDP-Murnac-Tetrapeptideについて、細胞壁結合ペプチドグリカンの形成と合計の両方で同様の見かけのKM値（30--80マム）を示します（すなわち、可溶性 +細胞壁結合）ペプチドグリカン。V値も同じ大きさです（タンパク質-1の270〜650 pmol x min-1 x mg）。ただし、UDP-Murnac-Tetrapeptideは、細胞壁結合ペプチドグルカンの形成のためにUDP-Murnac-Pentapeptideよりもわずかに優れた基質でした。UDP-Murnac-ペンタペプチドからの総および細胞壁結合ペプチドグリカンの合成は、UDP-Murnac-Tetrapeptideによって競合的に阻害され、その逆も同様です。UDP-Murnac-TripeptideとUDP-Mur-Nac-PentapeptideとUDP-Mur-Nac-Tetrapeptideの両方で、アセチル基のイプシロン - アミノ基がUDP-Murnac-ペンタペプチドよりも効率的に使用されなくなりました。可溶性ペプチドグリカンの形成のためのUDP-Murnac-Tetrapeptide;それらは、細胞壁結合ペプチドグリカンの形成のための非常に貧弱な基質でした。

Wall membrane enzyme preparations from Gaffkya homari catalyze the formation of peptidoglycan from the precursor pairs: UDP-N-acetylglucosamine + UDP-N-acetylmuramyl-pentapeptide (UDP-MurNAc-Ala-DGlu-Lys-DAla-DAla) and also from UDP-N-acetylglucosamine + UDP-N-acetylmuramyl-tetrapeptide (UDP-MurNAc-Ala-DGlu-Lys-DAla). Part of the reaction products is soluble in 2% sodium dodecylsfulfate whereas the other part is bound to pre-existing cell wall peptidoglycan. The incorporation into cell wall takes place by a transpeptidation reaction in which the D-alanyl-D-alanine sequences in the pre-existing cell wall function as donors and the epsilon-amino groups of the lysine residues in the newly synthesized peptidoglycan strands function as acceptors. Nepsilon-D-Alanyl-lysine linkages are formed. At saturating concentration of UDP-N-acetylglucosamine, the enzyme system exhibits similar apparent Km values (30--80 muM) for UDP-MurNAc-pentapeptide and UDP-MurNAc-tetrapeptide both for the formation of cell-wall bound peptidoglycan and total (i.e. soluble + cell-wall-bound) peptidoglycan. The V values are also in the same order of magnitude (270-650 pmol x min-1 x mg of protein -1). However, UDP-MurNAc-tetrapeptide was a slightly better substrate than UDP-MurNAc-pentapeptide for the formation of cell-wall-bound peptidoglucan. The synthesis of total and cell-wall-bound peptidoglycan from UDP-MurNAc-pentapeptide was competitively inhibited by UDP-MurNAc-tetrapeptide and vice versa. UDP-MurNAc-tripeptide and both UDP-Mur-NAc-pentapeptide and UDP-Mur-NAc-tetrapeptide in which the epsilon-amino group of the lysine residue was substituted by an acetyl group were utilized less efficiently than UDP-MurNAc-pentapeptide and UDP-MurNAc-tetrapeptide for the formation of soluble peptidoglycan; they were exceedingly poor substrates for the formation of cell-wall-bound peptidoglycan.