転写因子TFIIDの「TATA」ボックス結合成分のTata -Lessプロモーターの-30領域への機能的結合

RNAポリメラーゼIIによってより高い真核生物に転写される多くのウイルスおよび細胞プロモーターは、転写因子TFIIDを結合する「Tata」ボックスと呼ばれるA+Tリッチ配列を欠いています。そのようなTata-Lessプロモーターの1つであるSimian Virus 40 Major Late Promoterには、Tataボックスと明らかな配列類似性のない、転写開始部位の上流の遺伝的に重要なシーケンス要素30塩基対が含まれています。ここでは、クローン化されたヒトTATAボックス結合タンパク質であるHtfiid Tauがこの上流のシーケンス要素に機能的に結合することを示していますが、アデノウイルス2型主要な後期プロモーターのタタボックスを結合するアフィニティの6分の1があります。Simianウイルス40主要な後期プロモーターの-30要素の点変異の分析は、結合の親和性がこのプロモーターからの転写の効率と相関することを示しています。さらに、この要素には、TATAボックスの要素と同様の遺伝的特性があります。（i）RNAポリメラーゼIIに、その位置の下流の約30塩基ペアの転写を開始するように指示し、（II）この要素の不活性化により、転写開始部位の不均一性が増加します。テストされた他の5つのTATAレスプロモーターはすべて、HTFIID Tauが拘束する主要な転写開始部位の上流の約30塩基ペアのシーケンスを含むことがわかりました。すべてではないにしても、TATAのないプロモーターの多くは、TFIIDの結合のための-30領域の親和性においてTATAボックス含有プロモーターとは異なると結論付けています。。

Many viral and cellular promoters transcribed in higher eukaryotes by RNA polymerase II lack obvious A+T-rich sequences, called "TATA" boxes, that bind the transcription factor TFIID. One such TATA-less promoter, the simian virus 40 major late promoter, contains a genetically important sequence element 30 base pairs upstream of its transcription initiation site that has no obvious sequence similarity to a TATA box. We show here that the cloned human TATA box-binding protein, hTFIID tau, functionally binds to this upstream sequence element, although with an affinity one-sixth of that to which it binds the TATA box of the adenovirus type 2 major late promoter. Analysis of point mutations in the -30 element of the simian virus 40 major late promoter shows that the affinity of binding correlates with the efficiency of transcription from this promoter. Furthermore, this element has genetic properties similar to those of a TATA box. (i) It directs RNA polymerase II to initiate transcription approximately 30 base pairs downstream of its location, and (ii) inactivation of this element results in increased heterogeneity in the sites of transcription initiation. All of five other TATA-less promoters tested were found to contain a sequence approximately 30 base pairs upstream of their major transcription initiation sites to which hTFIID tau binds. We conclude that many, if not all, TATA-less promoters differ from TATA box-containing promoters simply in the affinity of their -30 regions for binding of TFIID, with functional binding of TFIID supported in part by other nearby sequence elements of the promoter.