E Coliの主要ヒストン様タンパク質であるHuは、IHFのORICへの結合を調節します

Huは、細菌の最も豊富なDNA結合タンパク質の1つです。Huが強力なシーケンス相同性や同様の予測構造を含む多くの特性を共有しているEscherichia coliの統合ホストファクターであるIHFとは異なり、Huは特定のサイトに拘束されるのに対し、IHFはDNAに非特異的に結合するようです。この作業では、HUとIHFの結合特性を、大腸菌（ORIC）の複製の最小起源を含むDNAフラグメントと比較し、このORICフラグメントに対するIHFの結合能力に対するHUの効果を分析します。HUは、この同じDNA配列へのIHFの特定の結合とは対照的に、ORICとランダムにおよび非特異的に相互作用することを示します。さらに、HuがIHFの特定のORICサイトへの結合を調節できることを示します。HuとIHFの相対濃度に応じて、HuはIHFのORICへの結合を活性化または阻害することができます。

HU is one of the most abundant DNA binding proteins of bacteria. Unlike IHF, integration host factor of Escherichia coli, with which HU shares many properties, including a strong sequence homology and similar predicted structure, HU seems to bind non-specifically to DNA whereas IHF binds to specific sites. In this work we compare the binding characteristics of HU and IHF to a DNA fragment containing the minimal origin of replication of E. coli (oriC) and we analyse the effect of HU on the binding capacity of IHF to this oriC fragment. We show that HU interacts randomly and non-specifically with oriC as opposed to the specific binding of IHF to this same DNA sequence. In addition, we show that HU can modulate the binding of IHF to its specific oriC site. Depending on the relative concentrations of HU and IHF, HU is able either to activate or to inhibit the binding of IHF to oriC.