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Genomics1992Nov01Vol.14issue(3)

女性患者のメンケス症候群に関連するブレークポイントの細かいマッピングとクローニング

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

メンケス症候群の原因となる遺伝子は、比較マッピングとリンケージ分析の組み合わせによりXQ13に割り当てられています。以前の報告では、PGK1とDXS56を含む6つの近位XQ13マーカーのグループに描かれた間隔に、女性患者の疾患に関連する転座ブレークポイントをマッピングしました。多くのPGK1またはDXS56陽性YACを特徴付けており、そこから6つの新しいマーカーを生成しました。そのうちの1人は、PGK1陽性YACと3つのDXS56陽性YACとの間の小さなオーバーラップ領域を識別します。DXS56陽性YACで覆われた560 kbの領域は、制限マップおよびサブクローニングされており、187 kbのMLUIフラグメントをブレークポイントにまたがって開示しています。同じ間隔で再配置の遠位にマッピングするプローブは、転座患者のDNAから構築されたハイブリッドのPGFEフラグメントの変化を明らかにします。近くのCPG島からブレークポイントを越えて150 kbを拡張するCosmid Contigの開発について説明します。このContigには、交差特有のハイブリダイゼーションを示す4つの隣接するクローンが含まれています。

メンケス症候群の原因となる遺伝子は、比較マッピングとリンケージ分析の組み合わせによりXQ13に割り当てられています。以前の報告では、PGK1とDXS56を含む6つの近位XQ13マーカーのグループに描かれた間隔に、女性患者の疾患に関連する転座ブレークポイントをマッピングしました。多くのPGK1またはDXS56陽性YACを特徴付けており、そこから6つの新しいマーカーを生成しました。そのうちの1人は、PGK1陽性YACと3つのDXS56陽性YACとの間の小さなオーバーラップ領域を識別します。DXS56陽性YACで覆われた560 kbの領域は、制限マップおよびサブクローニングされており、187 kbのMLUIフラグメントをブレークポイントにまたがって開示しています。同じ間隔で再配置の遠位にマッピングするプローブは、転座患者のDNAから構築されたハイブリッドのPGFEフラグメントの変化を明らかにします。近くのCPG島からブレークポイントを越えて150 kbを拡張するCosmid Contigの開発について説明します。このContigには、交差特有のハイブリダイゼーションを示す4つの隣接するクローンが含まれています。

The gene responsible for Menkes syndrome has been assigned to Xq13 by a combination of comparative mapping and linkage analysis. A previous report has mapped the translocation breakpoint associated with the disease in a female patient to an interval delimited by PGK1 and a group of six more proximal Xq13 markers, including DXS56. We have characterized a number of PGK1- or DXS56-positive YACs, from which we have generated six new markers. One of them identifies a small overlap region between a PGK1-positive YAC and three DXS56-positive YACs, distal to the Menkes breakpoint. A 560-kb region covered by a DXS56-positive YAC has been restriction-mapped and subcloned, disclosing a 187-kb MluI fragment astride the breakpoint. A probe mapping distal to the rearrangement in the same interval reveals altered PGFE fragments in a hybrid constructed from the translocation patient's DNA. We describe the development of a cosmid contig extending 150 kb from a nearby CpG island across the breakpoint. This contig includes four adjacent clones displaying cross-specific hybridization.

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