1、N2-エテノデオキシグアノシン：クロロアセトアルデヒド処理ポリヌクレオチドおよびDNAの特性と形成

1、N2-エテノ-2'-デオキシグアノシン（1、N2-Epsilon DGUO）は、以前はクロロアセトアルデヒド（CAA）反応の産物として報告されていなかったため、合成および特徴付けられています。K2CO3の存在下でのジメチルホルムアミド中のデオキシグアノシンとCAAの反応により、純粋な1、N2-エプシロンDGUOが55％の収率で調製されました。PKA値は2.2および9.2です。化合物のアニオン形式は、弱いが定義された蛍光を示します。強度は、中立性でのN2,3-エテノ-2'-デオキシグアノシン（N2,3-エプシロンdguo）の強度と類似しています。グリコシル結合の安定性1、N2-エプシロンDGUO（37度CでT1/2 = 2.3時間、pH 1）は、修飾されていないデオキシグアノシンよりも10倍大きく、異性体N2より少なくとも1000倍大きい10003-Epsilon dguo。CAAとモデルポリヌクレオチドの反応は、二本鎖構造におけるグアニン残基の水素結合が、予想どおり、1、N2-エテノグアニンの形成の重要な要因であることを示しています。対照的に、異性N2,3-エテノグアニンの形成は、DNAが単一鎖か二本鎖であるかどうかに比べて比較的独立しています。サケの精子DNAでは、中立性でCAAと反応し、1の形成はN2-エテノグアニンを実証できました。ただし、二本鎖DNAのこの付加物の形成の効率は、他のすべてのエチノ誘導体の効率よりも低いことがわかります。

1,N2-Etheno-2'-deoxyguanosine (1,N2-epsilon dGuo), not previously reported as a product of chloroacetaldehyde (CAA) reaction, has been synthesized and characterized. Reaction of deoxyguanosine with CAA in dimethylformamide in the presence of K2CO3 led to preparation of pure 1,N2-epsilon dGuo with 55% yield. pKa values are 2.2 and 9.2. The anionic form of the compound exhibits weak but defined fluorescence; the intensity is similar to that of N2,3-etheno-2'-deoxyguanosine (N2,3-epsilon dGuo) at neutrality. The stability of the glycosyl bond of 1,N2-epsilon dGuo (t1/2 = 2.3 h at 37 degrees C, pH 1) is 10-fold greater than of unmodified deoxyguanosine and at least one thousand-fold greater than of isomeric N2,3-epsilon dGuo. Reaction of CAA with model polynucleotides indicates that hydrogen bonding of guanine residues in the double-stranded structures is, as expected, an important factor in the formation of 1,N2-ethenoguanine. In contrast, the formation of isomeric N2,3-ethenoguanine is relatively independent of whether the DNA is single- or double-stranded. In salmon sperm DNA, reacted with CAA at neutrality, the formation of 1,N2-ethenoguanine could be demonstrated. However, we find the efficiency of formation of this adduct in double-stranded DNA to be lower than that of all other etheno derivatives.