エデンとパクタマイシンのリボソーム阻害メカニズムの解剖：普遍的に保存された残基G693およびC795は、P部品RNA結合を調節します

リボソーム30Sサブユニットに結合した普遍的な翻訳開始阻害剤のエデネインとパクタマイシンの結晶構造は、エデインがパクタマイシン結合部位を構成する残基のg693：C795の塩基対を誘導することを明らかにしました。ここでは、エデネインの添加により塩基対形成が、コドン - アニストン相互作用を防ぐことにより、P部位へのtRNA結合と、塩基対を再ブレイクするパクタマイシンの添加がこの阻害を緩和できることを示します。さらに、Edeineは、古典的な誤読抗生物質ストレプトマイシンによって誘発されるレベルに匹敵するレベルで、Aサイトで翻訳誤読を誘導します。残基G693とC795間のパクタマイシンの結合は、驚くべきtRNA特異性を伴う転座を強く阻害しますが、翻訳開始には影響しないため、この抗生物質の再分類が必要であることを示唆しています。集合的に、これらの結果は、普遍的に保存されたG693：C795残基がリボソームのP部位でTRNA結合を調節し、転座効率に影響を与えることを示唆しています。

The crystal structures of the universal translation-initiation inhibitors edeine and pactamycin bound to ribosomal 30S subunit have revealed that edeine induces base pairing of G693:C795, residues that constitute the pactamycin binding site. Here, we show that base pair formation by addition of edeine inhibits tRNA binding to the P site by preventing codon-anticodon interaction and that addition of pactamycin, which rebreaks the base pair, can relieve this inhibition. In addition, edeine induces translational misreading in the A site, at levels comparable to those induced by the classic misreading antibiotic streptomycin. Binding of pactamycin between residues G693 and C795 strongly inhibits translocation with a surprising tRNA specificity but has no effect on translation initiation, suggesting that reclassification of this antibiotic is necessary. Collectively, these results suggest that the universally conserved G693:C795 residues regulate tRNA binding at the P site of the ribosome and influence translocation efficiency.