タンパク質認識のための分子アーキテクチャとしてのアンキリンは繰り返されます

Ankyrinリピートは、タンパク質データベースで最も頻繁に観察されるアミノ酸モチーフの1つです。このタンパク質間相互作用モジュールは、細胞機能の多様なセットに関与しているため、多くのヒト疾患でアンキリンリピートタンパク質の欠陥が発見されています。最近の生物物理学的、結晶学的、およびNMR研究は、アンキリン反復タンパク質間相互作用の構造的基礎を理解するために、このモチーフのさまざまなトポロジー特徴を定義するために使用されてきました。折りたたみおよびアセンブリ経路の特性評価は、アンキリン反復ドメインがモジュラー構造にもかかわらず、2状態の折りたたみ遷移を受けることを示唆しています。また、多数の利用可能なシーケンスにより、アンキリンリピートをコンセンサスベースのタンパク質設計のテンプレートとして使用することができました。このようなプロジェクトは、アンキリンの繰り返しの構造と機能の原因となる立場を明らかにすることに成功し、分子認識のための潜在的な普遍的な足場を生み出しています。

The ankyrin repeat is one of the most frequently observed amino acid motifs in protein databases. This protein-protein interaction module is involved in a diverse set of cellular functions, and consequently, defects in ankyrin repeat proteins have been found in a number of human diseases. Recent biophysical, crystallographic, and NMR studies have been used to measure the stability and define the various topological features of this motif in an effort to understand the structural basis of ankyrin repeat-mediated protein-protein interactions. Characterization of the folding and assembly pathways suggests that ankyrin repeat domains generally undergo a two-state folding transition despite their modular structure. Also, the large number of available sequences has allowed the ankyrin repeat to be used as a template for consensus-based protein design. Such projects have been successful in revealing positions responsible for structure and function in the ankyrin repeat as well as creating a potential universal scaffold for molecular recognition.