人間の皮膚のトランスクリプトミクスとプロテオミクス

表皮は、物理的、化学的、生物学的課題から生物を保護し、環境と身体の間のシグナル伝達界面として機能します。これらの機能を実行するために、表皮ケラチノサイトは幅広い遺伝子を発現しており、そのいくつかは以前に特徴付けられています。最近、ケラチノサイト遺伝子発現の大規模な分析では大きな進歩が遂げられ、ケラチノサイト生物学とヒト皮膚疾患に対するより深い洞察が可能になりました。トランスクリプトーム分析 - 遺伝子発現（SAGE）およびマイクロアレイの領域分析 - およびプロテオーム分析は、正常および病気のヒト表皮を模倣するモデルシステムで培養された無傷のヒト表皮およびケラチノサイトで行われています。ここでは、SAGEと補完的なDNAマイクロアレイに重点を置いて、人間の皮膚の大規模な遺伝子発現分析の現在の状態を確認します。さまざまなアプローチのメリットと制限（トランスクリプトミックとプロテオミクス）について説明し、皮膚生検からのサンプル調製などの実用的な問題、およびin vitroモデルの使用について簡単に説明します。

The epidermis protects the organism against physical, chemical and biological challenges, and it acts as a signalling interface between the environment and the body. In order to perform these functions, the epidermal keratinocytes express a wide range of genes, several of which have been characterised previously. Recently, significant progress has been made in the large-scale analysis of keratinocyte gene expression, enabling a more profound insight into keratinocyte biology and human skin diseases. Transcriptome analysis--serial analysis of gene expression (SAGE) and microarrays--and proteome analysis have been performed on intact human epidermis and on keratinocytes cultured in model systems that mimic normal and diseased human epidermis. Here, we review the current state of large-scale gene expression analysis of human skin, with an emphasis on SAGE and complementary DNA microarrays. The merits and limitations of various approaches (transcriptomics versus proteomics) are discussed and the practical issues such as sample preparation from skin biopsies, and the use of in vitro models are briefly addressed.