アセトニトリル中でのデオキシリボヌクレオシドホスホルアミダイトの溶液安定性と分解経路

5'-O-ジメトキシトリチル (DMT) で保護されたデオキシリボヌクレオシド (dG(ib)、dA(bz)、dC(bz)、T) の 4 つの標準 O-シアノエチル-N,N-ジイソプロピル-ホスホルアミダイト (dG(ib)、dA(bz)、dC(bz)、T) のアセトニトリル溶液の不純物プロファイルを HPLC-MS で分析しました。ホスホラミダイトの溶液安定性は、T、dC>dA>dG の順に低下します。不活性ガス雰囲気下で５週間保管した後、アミダイト純度はそれぞれ２％（Ｔ、ｄＣ）、６％（ｄＡ）、および３９％（ｄＧ）減少した。主な分解経路には、加水分解、アクリロニトリルの除去、および自己触媒によるアクリロニトリル誘導性のシアノエチルホスホノアミド酸の形成が含まれます。したがって、モレキュラーシーブを使用して溶液中の水分濃度を下げ、アミダイト濃度を下げることにより、分解速度が低下します。酸触媒による加水分解は、少量の塩基を添加することによっても軽減できます。

The impuritiy profiles of acetonitrile solutions of the four standard O-cyanoethyl-N,N-diisopropyl-phosphoramidites of 5'-O-dimethoxytrityl (DMT) protected deoxyribonucleosides (dG(ib), dA(bz), dC(bz), T) were analyzed by HPLC-MS. The solution stability of the phosphoramidites decreases in the order T, dC>dA>dG. After five weeks storage under inert gas atmosphere the amidite purity was reduced by 2% (T, dC), 6% (dA), and 39% (dG), respectively. The main degradation pathways involve hydrolysis, elimination of acrylonitrile and autocatalytic acrylonitrile-induced formation of cyanoethyl phosphonoamidates. Consequently, the rate of degradation is reduced by reducing the water concentration in solution with molecular sieves and by lowering the amidite concentration. Acid-catalyzed hydrolysis could also be reduced by addition of small amounts of base.