飽和転移違いNMRによる抗ウイルス剤シアノビリン-Nとオリゴマンノシドとの相互作用の原子マッピングNMR

強力なHIV不活性化タンパク質シアノウイルン-N（CV-N）への結合に必要な最小オリゴ糖構造は、飽和転移違い（STD）NMR分光法によって決定されました。タンパク質の低分子量（11 kDa）にもかかわらず、STD-NMR分光法により、CV-Nとさまざまなダイおよびトリマンノシドとの相互作用の正確な原子マッピング、MA-9の下部構造、HIVウイルス表面の優勢な乏糖が可能になりました。糖タンパク質GP120。MAN-9の末端マナルファ（1-> 2）のマナルファユニットを含むマンノシドとの接触が観察されましたが、（1-> 3） - および（1-6）結合DIおよびトリマンノシドは相互作用を示しず、ターミナルマナルファ（1-> 2）マナルファ構造は、相互作用において重要な役割を果たします。正確なエピトープマッピングは、マナルファ（1-> 2）マナルファーム、マナルファ（1-> 2）マナルファ（1-> 3）マナルファーム、マナルファ（1-> 2）マナルファ（1-> 2）6）マナルファイオーム、タンパク質は、非還元末端マンノースユニットのH2、H3、およびH4と密接に接触しています。対照的に、CV-N/Trisaccharide ManalphaのSTD-NMRスペクトル（1-> 2）マナルファ（1-> 2）マナルファオーム複合体は著しく異なり、すべての砂糖ユニットの共鳴が等しい強化を示し、CVはCVを示唆しています。-Nは、構造的に関連する3つの三糖を区別できます。

The minimum oligosaccharide structure required for binding to the potent HIV-inactivating protein cyanovirin-N (CV-N) was determined by saturation-transfer difference (STD) NMR spectroscopy. Despite the low molecular mass of the protein (11 kDa), STD-NMR spectroscopy allowed the precise atomic mapping of the interactions between CV-N and various di- and trimannosides, substructures of Man-9, the predominant oligosaccharide on the HIV viral surface glycoprotein gp120. Contacts with mannosides containing the terminal Manalpha(1-->2)Manalpha unit of Man-9 were observed, while (1-->3)- and (1-6)-linked di- and trimannosides showed no interactions, demonstrating that the terminal Manalpha(1-->2)Manalpha structure plays a key role in the interaction. Precise epitope mapping revealed that, for Manalpha(1-->2)ManalphaOMe, Manalpha(1-->2)Manalpha(1-->3)ManalphaOMe, and Manalpha(1-->2)Manalpha(1-->6)ManalphaOMe, the protein is in close contact with H2, H3, and H4 of the nonreducing terminal mannose unit. In contrast, the STD-NMR spectrum of the CV-N/trisaccharide Manalpha(1-->2)Manalpha(1-->2)ManalphaOMe complex was markedly different, with resonances on all sugar units displaying equal enhancements, suggesting that CV-N is able to discriminate between the three structurally related trisaccharides.