哺乳類の細胞ベースのスクリーンで使用するために、生分解性ポリマーに埋め込まれた小分子のマイクロアレイ

哺乳類細胞の小分子をスクリーニングするためのマイクロアレイベースのシステムを開発しました。このシステムは、画像ベースの画面と互換性があり、化合物ごとに100個未満のセルが必要です。各化合物は、生分解性ポリ（d）、（l） - ラクチド/グリコリド共重合体で構成される200マイコム直径椎間板に含浸されています。細胞はこれらのディスクの上に播種され、化合物はゆっくりと拡散し、近位細胞に影響を与えます。マイクロタイターベースのスクリーニングとは対照的に、このシステムは、各化合物処理された細胞グループ間のウェルまたは壁の使用を伴いません。大きなマイクロアレイでの単一の化合物の効果の検出を示します。この形式で多様な化合物を放出できることを示し、数日間にわたって拡張された放出が実現可能です。小さな合成致死スクリーニングを実行し、結節性硬化症の発現のRNA干渉媒介性減少を伴う細胞の活性を低下させる化合物（MacBecin II）を特定しました。したがって、効果をテストするためのマイクロアレイベースのスクリーニングシステムを開発しました。イメージングベースの読み取りを使用して、哺乳類細胞の小分子の。この方法は、新しい化学物質ツールと潜在的な治療薬を発見するために、小分子スクリーンを実行している人に役立ちます。

We developed a microarray-based system for screening small molecules in mammalian cells. This system is compatible with image-based screens and requires fewer than 100 cells per compound. Each compound is impregnated in a 200-microm-diameter disc composed of biodegradable poly-(D),(L)-lactide/glycolide copolymer. Cells are seeded on top of these discs, and compounds slowly diffuse out, affecting proximal cells. In contrast with microtiter-based screening, this system does not involve the use of wells or walls between each compound-treated group of cells. We demonstrate detection of the effects of a single compound in a large microarray, that diverse compounds can be released in this format, and that extended release over several days is feasible. We performed a small synthetic lethal screen and identified a compound (macbecin II) that has reduced activity in cells with RNA interference-mediated decrease in the expression of tuberous sclerosis 2. Thus, we have developed a microarray-based screening system for testing the effects of small molecules on mammalian cells by using an imaging-based readout. This method will be useful to those performing small-molecule screens to discover new chemical tools and potential therapeutic agents.