RCSBプロテインデータバンク：MMCIFスキーマに基づく再設計されたクエリシステムとリレーショナルデータベース

Protein Data Bank（PDB）は、生物学的高分子の3次元（3D）構造データの中央世界のリポジトリです。構造バイオインフォマティクス（RCSB）の研究協力は、3D構造データの分布とクエリのリソースを完全に再設計しました。再設計されたサイトは現在、http：//pdbbeta.rcsb.orgで公開ベータテストにあります。新しいサイトは、構造データをより詳細に均一に提供し、クエリの改善と拡張分析ツールを提供することにより、既存のサイトの機能を拡張します。新しい重要な機能は、ゲノム、プロテオーム、疾患の関係をカバーする20を超える他のソースからのデータの統合と検索性です。2005年後半のhttp://www.pdb.orgのRCSB生産サイトになるリエンジニアリングサイトの現在の機能について説明します。

The Protein Data Bank (PDB) is the central worldwide repository for three-dimensional (3D) structure data of biological macromolecules. The Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) has completely redesigned its resource for the distribution and query of 3D structure data. The re-engineered site is currently in public beta test at http://pdbbeta.rcsb.org. The new site expands the functionality of the existing site by providing structure data in greater detail and uniformity, improved query and enhanced analysis tools. A new key feature is the integration and searchability of data from over 20 other sources covering genomic, proteomic and disease relationships. The current capabilities of the re-engineered site, which will become the RCSB production site at http://www.pdb.org in late 2005, are described.