明確な前発生型組織遺伝学的ドメインは、鳥類中脳におけるOTX2およびPAX2遺伝子発現の重複によって定義されます

OTX2、PAX2、GBX2、およびFGF8 mRNAプローブの隣接するシリアルセクションでのOTX2、PAX2、GBX2、およびFGF8 mRNAプローブの相関内脳骨および腸のハイブリダイゼーションは、発達の初期段階から中間段階で隣接するシリアルセクションを介して、OTX2およびPAX2転写産物のオーバーラップの領域を詳細にマッピングするのに役立ちました。。この先立式ドメイン内で発達する神経集団は、中脳網状網状層、骨間核、および大細胞（pre）核核の尾側部分に加えて、腹水灰色の対応する部分を構成しました。Torus semicircularis-dourter colliculusホモログがその心室内層のOTX2を独占的に発現しましたが、Pax2を発現することはありませんでした。小胞の腸核は、中脳葉の内側に配置されていますが、OTX2を発現することはなく、その細胞は早期の過渡Pax2シグナルを急速に下方制御しました。このパターンは、報告されている腸の起源と前方接線の転座と一致しています。この分析は、少なくともalarプレートでは、縦軸に沿った4つの異なる中脳の組織形成ドメインの存在を明らかにしています。これらは、おそらく、尾側FGF8モルフォゲン源（ISTHMIC FGF8陽性ドメイン）とは異なる距離でのOTX2発現中脳ニューロエピテリウムに対する段階的な腸内オーガナイザー効果に起因します。これらのドメインの最終的な表現型は組織学的に多様であり、グリセアムテクタール（吻側）、視神経皮質、トーラス半皮質、および現在特徴づけられているプリステミックドメイン（腸の主催者に最も近い）を構成しています。爬虫類と哺乳類の利用可能な比較データは、このスキームの一般的な妥当性を示唆しています。

Correlative in situ hybridization of Otx2, Pax2, Gbx2, and Fgf8 mRNA probes in adjacent serial sections through the chicken midbrain and isthmus at early to intermediate stages of development served to map in detail the area of overlap of Otx2 and Pax2 transcripts in the caudal midbrain. The neuronal populations developing within this preisthmic domain made up a caudal part of the midbrain reticular formation, the interfascicular nucleus, and the magnocellular (pre)isthmic nucleus, plus the corresponding part of the periaqueductal gray. The torus semicircularis-the inferior colliculus homolog-expressed Otx2 in its ventricular lining exclusively, but it never expressed Pax2. The parvicellular isthmic nucleus, although placed inside the midbrain lobe, never expressed Otx2, and its cells rapidly down-regulated an early transient Pax2 signal; this pattern is consistent with its reported isthmic origin and forward tangential translocation. This analysis reveals the existence of four distinct midbrain histogenetic domains along the longitudinal axis, at least for the alar plate. These presumably result from step-like isthmic organizer effects on Otx2-expressing midbrain neuroepithelium at different distances from a caudal FGF8 morphogen source (isthmic Fgf8-positive domain). The final phenotypes of these domains are histologically diverse and make up the griseum tectale (rostrally), the optic tectum, the torus semicircularis, and the presently characterized preisthmic domain (lying closest to the isthmic organizer). Available comparative data for reptiles and mammals suggest the general validity of this scheme.