TOX-PROT、スイスプロットタンパク質の知識ベースの毒素タンパク質注釈プログラム

Tox-Protプログラムは、科学コミュニティに動物タンパク質毒素に関する現在の知識の概要を提供するために開始されました。このプログラムの目的は、毒素として作用し、有毒な動物によって生成されるすべてのタンパク質に体系的に注釈を付けることです。ヘビ、サソリ、クモ、クラゲ、昆虫、コーンカタツムリ、アネモネ、トカゲ、魚、カタネズミなどの有毒な動物には、獲物に毒液を注入するための特殊な器官が装備されています。対照的に、一部の魚や虫などの有毒な動物には、そのような臓器がありません。各毒素には、スイスプロットの品質基準に従って注釈が付けられています。これは、関数、ドメイン構造、細胞内位置、組織の特異性、バリアント、他のタンパク質との類似性、キーワードなどの説明を含む豊富な情報を提供することを意味します。機能と作用モード、翻訳後修飾、およびタンパク質毒素の分野ですべて比較的豊富な3D構造データで知られています。研究者は、tox-prot@isb-sib.chの毒素に関するスイスプロットに関連する調査結果を提出することにより、科学コミュニティに知識を提供することを歓迎します。TOX-Protの詳細については、http：//www.expasy.org/sprot/tox-protをご覧ください。

The Tox-Prot program was initiated in order to provide the scientific community a summary of the current knowledge on animal protein toxins. The aim of this program is to systematically annotate all proteins which act as toxins and are produced by venomous and poisonous animals. Venomous animals such as snakes, scorpions, spiders, jellyfish, insects, cone snails, sea anemones, lizards, some fish, and platypus are equipped with a specialized organ to inject venom in their prey. In contrast, poisonous animals such as some fish or worms, lack such organs. Each toxin is annotated according to the quality standards of Swiss-Prot. This means providing a wealth of information that includes the description of the function, domain structure, subcellular location, tissue specificity, variants, similarities to other proteins, keywords, etc. In the framework of this program, particular care has been made to capture what is known on the function and mode of action, posttranslational modifications and 3D structural data which are all relatively abundant in the field of protein toxins. Researchers are welcome to contribute their knowledge to the scientific community by submitting relevant findings to Swiss-Prot concerning toxins at Tox-Prot@isb-sib.ch. More information on Tox-Prot can be found at http://www.expasy.org/sprot/tox-prot.