4種のエンタモエバ原生動物におけるDNAトランスポゾンの予期せぬ多様性と異なる成功

ドラフトシーケンスが現在利用可能になった4種のEntamoebaユニセルラー原生動物のコンパクトゲノム（約20 MB）の転置可能な要素含有量の最初の包括的な分析を報告します。2つのヒト寄生虫であるEntamoeba HistolyticaとEntamoeba Disparには、多くのレトロトランスポゾンがありますが、DNAトランスポゾンはほとんどありません。対照的に、爬虫類の寄生虫のエンタモエバの侵略と自由生活のエンタモエバ・モシュコフスキーには、DNAトランスポゾンの多様で最近増幅された集団がありますが、長い散在する要素はほとんど含まれていません。3つのDNAトランスポサゼスーパーファミリー（HOBO/活性化因子/TAM3、変異体、およびピギーバック）の代表者は、4番目のスーパーファミリー（TC1/マリナー）のさまざまなメンバーに加えて、原生動物種で初めて特定されました。原生動物の中の膣トリコモナス。DNAトランスポゾンの多様性と、同様のコンパクトゲノムを持つ密接に関連する種の間でのそれらの微分増幅については、Entamoeba Prosozoansの生物学の文脈で議論されています。

We report the first comprehensive analysis of transposable element content in the compact genomes (approximately 20 Mb) of four species of Entamoeba unicellular protozoans for which draft sequences are now available. Entamoeba histolytica and Entamoeba dispar, two human parasites, have many retrotransposons, but few DNA transposons. In contrast, the reptile parasite Entamoeba invadens and the free-living Entamoeba moshkovskii contain few long interspersed elements but harbor diverse and recently amplified populations of DNA transposons. Representatives of three DNA transposase superfamilies (hobo/Activator/Tam3, Mutator, and piggyBac) were identified for the first time in a protozoan species in addition to a variety of members of a fourth superfamily (Tc1/mariner), previously reported only from ciliates and Trichomonas vaginalis among protozoans. The diversity of DNA transposons and their differential amplification among closely related species with similar compact genomes are discussed in the context of the biology of Entamoeba protozoans.