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Rapid communications in mass spectrometry : RCM1992Jan01Vol.6issue(1)

ミオグロビンの正しい分子量、質量分析の一般的な対応

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.
概要
Abstract

馬の心筋、馬の骨格筋、精子クジラのミオグロビンは、さまざまな質量分析方法のキャリブレーション基準または試験化合物として広く使用されています。文献で報告されているすべてのこのような場合において、この153アミノ酸ロングタンパク質のアミノ酸122がアスパラギンであるという仮定に基づいた分子量値(それぞれ16,950.5および17,199)が使用され、公表された提案を見落としているという仮定に基づいています。代わりにアスパラギン酸です。マトリックス支援レーザー脱着質量分析の質量割り当て精度は+/- 0.01%であり、エレクトロスプレーイオン化+/- 0.0025%であると報告されているため、1つの質量単位の誤差は重要です。市販の馬の心臓および馬の骨格ミオグロビン、後者のアポミョグロビン、および精子乳房乳頭ミオグロビンのトリプティックおよびキモトリシスのペプチドに由来するアミノ酸122を含むトリプティックペプチドのイオンの質量対電荷比は、プロテインアミノアミノアミノの両方でそれを証明したことが証明されました。酸122は、アスパラギンではなく、実際にアスパラギン酸です。この発見は、馬ミオグロビンからのトリプシンペプチドの[M + H] +イオンの衝突誘発性解離スペクトルと、精子クジラミオグロビンからのキモトリプチンペプチドの衝突誘発解離スペクトルによってさらに確認されました。したがって、馬ミオグロビンの正しい分子量は16,951.49であり、精子クジラのタンパク質の正しい分子量は17,199.91です。

馬の心筋、馬の骨格筋、精子クジラのミオグロビンは、さまざまな質量分析方法のキャリブレーション基準または試験化合物として広く使用されています。文献で報告されているすべてのこのような場合において、この153アミノ酸ロングタンパク質のアミノ酸122がアスパラギンであるという仮定に基づいた分子量値(それぞれ16,950.5および17,199)が使用され、公表された提案を見落としているという仮定に基づいています。代わりにアスパラギン酸です。マトリックス支援レーザー脱着質量分析の質量割り当て精度は+/- 0.01%であり、エレクトロスプレーイオン化+/- 0.0025%であると報告されているため、1つの質量単位の誤差は重要です。市販の馬の心臓および馬の骨格ミオグロビン、後者のアポミョグロビン、および精子乳房乳頭ミオグロビンのトリプティックおよびキモトリシスのペプチドに由来するアミノ酸122を含むトリプティックペプチドのイオンの質量対電荷比は、プロテインアミノアミノアミノの両方でそれを証明したことが証明されました。酸122は、アスパラギンではなく、実際にアスパラギン酸です。この発見は、馬ミオグロビンからのトリプシンペプチドの[M + H] +イオンの衝突誘発性解離スペクトルと、精子クジラミオグロビンからのキモトリプチンペプチドの衝突誘発解離スペクトルによってさらに確認されました。したがって、馬ミオグロビンの正しい分子量は16,951.49であり、精子クジラのタンパク質の正しい分子量は17,199.91です。

Myoglobins from horse heart muscle, horse skeletal muscle and sperm whale are widely used as calibration standards or test compounds for various mass spectrometric methodologies. In all such cases reported in the literature, a molecular weight value is used (16,950.5 and 17,199, respectively) which is based on the assumption that amino acid 122 in this 153 amino-acid-long protein is asparagine, overlooking a published suggestion that it is aspartic acid instead. Since the mass assignment accuracy for matrix-assisted laser desorption mass spectrometry is reported to be +/- 0.01% and for electrospray ionization +/- 0.0025%, and error of one mass unit in approximately 17,000 would be significant. The mass-to-charge ratio of ions of the tryptic peptide encompassing amino acid 122 derived from commercially available horse heart and horse skeletal myoglobins, the apomyoglobin of the latter, and the tryptic and chymotryptic peptide of sperm whale myoglobin proved that in both proteins amino acid 122 is indeed aspartic acid, rather than asparagine. This finding was further confirmed by the collision-induced dissociation spectra of the [M + H]+ ions of the tryptic peptides from the horse myoglobins and the chymotriptic peptide from sperm whale myoglobin. Thus, the correct molecular weight of horse myoglobin is 16,951.49 and that of the sperm whale protein is 17,199.91.

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