Bingo：生物ネットワークにおける遺伝子オントロジーカテゴリの過剰表現を評価するためのCytoscapeプラグイン

Biological Networks Gene Ontology Tool（BINGO）は、どの遺伝子オントロジー（GO）の用語が遺伝子のセットで大幅に過剰に表現されるかを判断するオープンソースJavaツールです。ビンゴは、テキストとして貼り付けられた遺伝子のリストで、または細胞鏡で視覚化された生物学的ネットワークのサブグラフでインタラクティブに使用できます。Bingoは、GO階層に設定されたテストされた遺伝子の主要な機能テーマをマップし、Cytoscapeの多用途の視覚化環境を利用して、結果の直感的でカスタマイズ可能な視覚表現を生成します。

The Biological Networks Gene Ontology tool (BiNGO) is an open-source Java tool to determine which Gene Ontology (GO) terms are significantly overrepresented in a set of genes. BiNGO can be used either on a list of genes, pasted as text, or interactively on subgraphs of biological networks visualized in Cytoscape. BiNGO maps the predominant functional themes of the tested gene set on the GO hierarchy, and takes advantage of Cytoscape's versatile visualization environment to produce an intuitive and customizable visual representation of the results.