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American journal of human genetics2005Sep01Vol.77issue(3)

アフリカ系アメリカ人と白人におけるBTNL2遺伝子とサルコイドーシス症の感受性

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文献タイプ:
  • Comparative Study
  • Journal Article
  • Research Support, N.I.H., Extramural
  • Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.
概要
Abstract

BTNL2遺伝子は、おそらくT細胞共刺激分子として機能するB7受容体ファミリーのメンバーです。染色体6PのクラスII主要組織適合性複合体(MHC)領域に存在し、最近、ドイツの白人集団のサルコイドーシス感受性に関連しています。私たちは、アフリカ系アメリカ人家族ベースの研究集団(n = 219の核家族)と2つの症例対照集団(1つのアフリカ系アメリカ人(n = 295ペア)と1つの白(n = 366ペア)でBTNL2協会を再現しようとしました。BTNL2のエクソン/イントロン5にまたがる490 bp領域内で10個のSNPが検出されました。この地域内のハプロタイプの変動は、3つの研究集団すべてでサルコイドーシスと有意に関連していましたが、アフリカ系アメリカ人の症例対照(p = .02)または家族ベース(p = .03)よりも白人(p = .0006)でより多く関連していました。サンプル。最強のサルコイドーシス協会であるRS2076530を備えた以前に報告されたBTNL2 SNPは、白人集団で最も強力な関連性を持つSNPでもありました(p <.0001)。RS2076530の対立遺伝子は、早期のエクソンスプライス部位をもたらし、サルコイドーシスのリスクを増加させます(オッズ比= 2.03; 95%信頼区間1.32-3.12)。RS2076530はアフリカ系アメリカ人サンプルのいずれのサンプルでもサルコイドーシスとは関連していませんでしたが、RS2076530を含む3焦点のハプロタイプは、3つの研究サンプルすべてにわたってサルコイドーシスと関連していました。多変数ロジスティック回帰分析は、BTNL2効果は白人のヒト白血球抗原クラスII遺伝子に依存しないが、アフリカ系アメリカ人では敵対的に相互作用する可能性があることを示した。私たちの結果は、MHC地域から発せられるサルコイドーシスの遺伝的リスクの複雑さを強調しています。

BTNL2遺伝子は、おそらくT細胞共刺激分子として機能するB7受容体ファミリーのメンバーです。染色体6PのクラスII主要組織適合性複合体(MHC)領域に存在し、最近、ドイツの白人集団のサルコイドーシス感受性に関連しています。私たちは、アフリカ系アメリカ人家族ベースの研究集団(n = 219の核家族)と2つの症例対照集団(1つのアフリカ系アメリカ人(n = 295ペア)と1つの白(n = 366ペア)でBTNL2協会を再現しようとしました。BTNL2のエクソン/イントロン5にまたがる490 bp領域内で10個のSNPが検出されました。この地域内のハプロタイプの変動は、3つの研究集団すべてでサルコイドーシスと有意に関連していましたが、アフリカ系アメリカ人の症例対照(p = .02)または家族ベース(p = .03)よりも白人(p = .0006)でより多く関連していました。サンプル。最強のサルコイドーシス協会であるRS2076530を備えた以前に報告されたBTNL2 SNPは、白人集団で最も強力な関連性を持つSNPでもありました(p <.0001)。RS2076530の対立遺伝子は、早期のエクソンスプライス部位をもたらし、サルコイドーシスのリスクを増加させます(オッズ比= 2.03; 95%信頼区間1.32-3.12)。RS2076530はアフリカ系アメリカ人サンプルのいずれのサンプルでもサルコイドーシスとは関連していませんでしたが、RS2076530を含む3焦点のハプロタイプは、3つの研究サンプルすべてにわたってサルコイドーシスと関連していました。多変数ロジスティック回帰分析は、BTNL2効果は白人のヒト白血球抗原クラスII遺伝子に依存しないが、アフリカ系アメリカ人では敵対的に相互作用する可能性があることを示した。私たちの結果は、MHC地域から発せられるサルコイドーシスの遺伝的リスクの複雑さを強調しています。

The BTNL2 gene is a member of the B7 receptor family that probably functions as a T-cell costimulatory molecule. It resides in the class II major histocompatibility complex (MHC) region of chromosome 6p and has recently been associated with sarcoidosis susceptibility in a white German population. We sought to replicate the BTNL2 association in an African American family-based study population (n=219 nuclear families) and two case-control populations--one African American (n=295 pairs) and one white (n=366 pairs). Ten SNPs were detected within a 490-bp region spanning exon/intron 5 of BTNL2. Haplotype variation within this region was significantly associated with sarcoidosis in all three study populations but more so in whites (P=.0006) than in the African American case-control (P=.02) or family-based (P=.03) samples. The previously reported BTNL2 SNP with the strongest sarcoidosis association, rs2076530, was also the SNP with the strongest association in our white population (P<.0001). The A allele of rs2076530 results in a premature exon-splice site and increases risk for sarcoidosis (odds ratio=2.03; 95% confidence interval 1.32-3.12). Although rs2076530 was not associated with sarcoidosis in either African American sample, a three-locus haplotype that included rs2076530 was associated with sarcoidosis across all three study samples. Multivariable logistic regression analyses showed that BTNL2 effects are independent of human leukocyte antigen class II genes in whites but may interact antagonistically in African Americans. Our results underscore the complexity of genetic risk for sarcoidosis emanating from the MHC region.

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