エキソヌクレアーゼIIIによるDNAのDNAマイクロアレイの消化によるDNAの酵素的に増幅された表面プラズモン共鳴画像検出

このホワイトペーパーでは、表面プラズモン共鳴（SPR）イメージングを伴う一本鎖DNA（SSDNA）の増幅検出のために、3'端端のDNAマイクロアレイと組み合わせた酵素エキソヌクレアーゼIIIを利用した新しいアプローチについて説明します。exoiiiと標的DNAが3 '末端のssDNAマイクロアレイに同時に導入されると、標的ssDNAのハイブリダイゼーション吸着により、プローブssDNA鎖の方向依存性エキソリシ溶解が発生し、無効ターゲットssDNAの解放が解決につながります。ターゲットSSDNAの別のプローブへの再吸着は、SPRイメージング信号の有意な負の変化で時間とともに生じる繰り返しの加水分解プロセスを作成します。二本鎖DNAとのExOIIIの方向依存性表面酵素反応と、16M-MER標的SSDNA検出限界を午後10時から100分にしたこの新しい酵素的に増幅されたSPRイメージングプロセスを示す実験が提示されます。これは、酵素増幅なしのハイブリダイゼーション吸着にのみに基づいて、SsDNAのSPRイメージング検出の以前に報告された測定の10（2）-10（3）改善です。

This paper describes a novel approach utilizing the enzyme exonuclease III in conjunction with 3'-terminated DNA microarrays for the amplified detection of single-stranded DNA (ssDNA) with surface plasmon resonance (SPR) imaging. When ExoIII and target DNA are simultaneously introduced to a 3'-terminated ssDNA microarray, hybridization adsorption of the target ssDNA leads to the direction-dependent ExoIII hydrolysis of probe ssDNA strands and the release of the intact target ssDNA back into the solution. Readsorption of the target ssDNA to another probe creates a repeated hydrolysis process that results over time in a significant negative change in SPR imaging signal. Experiments are presented that demonstrate the direction-dependent surface enzyme reaction of ExoIII with double-stranded DNA as well as this new enzymatically amplified SPR imaging process with a 16-mer target ssDNA detection limit of 10-100 pM. This is a 10(2)-10(3) improvement on previously reported measurements of SPR imaging detection of ssDNA based solely on hybridization adsorption without enzymatic amplification.