染色体異常の検出のための分割型魚

染色体異常は、造血悪性腫瘍で頻繁に観察されます。これらの異常は、癌遺伝子の発現を緩和する可能性があり、異常な発現または過剰発現をもたらすか、白血病特異的キメラ融合タンパク質を形成する可能性があります。染色体異常の検出は、悪性腫瘍の分類と、異なる治療プロトコルが必要なリスクグループの定義のための重要なツールです。私たちは、頻繁に発生する染色体異常のために、迅速かつ敏感な分裂蛍光in situハイブリダイゼーション（FISH）アッセイを開発しました。スプリットシグナル魚のアプローチは、ブレークポイント領域の反対側部位の1つの遺伝子にある2つの差次的に標識されたプローブを使用します。正常な核型では、2つの共局在した緑/赤の信号が見えますが、転座は共局在した信号の1つを分割します。スプリットシグナル魚には、2つの遺伝子にある2つの標識プローブを使用する古典的な融合署名魚アプローチよりも3つの主要な利点があります。まず、染色体異常の検出は、関与するパートナー遺伝子とは無関係です。第二に、分割されたシグナル魚により、中期スプレッドが存在する場合、パートナー遺伝子または染色体領域の識別が可能になり、最終的に偽陽性が低下します。

Chromosome aberrations are frequently observed in hematopoietic malignancies. These aberrations can deregulate expression of an oncogene, resulting in aberrant expression or overexpression, or they can form leukemia-specific chimeric fusion proteins. Detection of chromosome aberrations is an important tool for classification of the malignancy and for the definition of risk groups, which need different treatment protocols. We developed rapid and sensitive split-signal fluorescent in situ hybridization (FISH) assays for frequently occuring chromosome aberrations. The split-signal FISH approach uses two differentially labeled probes, located in one gene at opposite sites of the breakpoint region. In normal karyotypes, two co-localized green/red signals are visible, but a translocation results in a split of one of the co-localized signals. Split-signal FISH has three main advantages over the classical fusion-signal FISH approach, which uses of two labeled probes located in two genes. First, the detection of a chromosome aberration is independent of the involved partner gene. Second, split-signal FISH allows the identification of the partner gene or chromosome region if metaphase spreads are present, and finally it reduces false-positivity.