検体アガロースゲル電気泳動における異なる蛍光色素のDNA染色効率の比較分析

臭化エチジウム（EB）は、核酸の視覚化のために実験室で広く使用されている変異剤と毒素です。Sybr Gold、Sybr Green、Goldview、Genefinder、Goldstarなどのより安全な核酸染色が開発されました。しかし、これらの染料の染色効率の体系的な比較分析はありませんでした。本研究では、Sybr Gold、Sybr Green I、Goldview、およびEBが比較されました。SYBRゴールドとSYBRグリーンはどちらも電気泳動移動度を変え、したがってDNAサイズの推定値を変化させますが、EBの費用対効果の高い代替品です。Sybr Goldは、短いフラグメントの検出でSybr Green Iよりも敏感でしたが、長い統合時間で視覚化すると、いずれかの染料を使用して50 bpのバンドがはっきりと見えました。Sybr GoldまたはSybr Green Iは、EBに敏感で比較的安全な代替品です。私たちの研究室では、SYBRゴールド法は現在、私たちのグループのすべてのメンバーによって日常的に使用されています。

Ethidium bromide (EB) is a mutagen and toxin that is widely used in the laboratory for visualization of nucleic acids. Safer nucleic acid stains, such as SYBR Gold, SYBR Green, GoldView, GeneFinder, and GoldStar, have been developed. However, there has been no systematic comparative analysis of the staining efficiencies of these dyes. In the present study, SYBR Gold, SYBR Green I, GoldView and EB were compared. Although both SYBR Gold and SYBR Green alter electrophoretic mobility and thus DNA size estimates, they are cost-effective alternatives to EB. SYBR Gold was more sensitive than SYBR Green I at detecting short fragments, but 50-bp bands were clearly visible using either dye when visualized with a long integration time. SYBR Gold or SYBR Green I are sensitive and relatively safe alternatives to EB. In our laboratory, the SYBR Gold method is now used routinely by all members of our group with great consistency and success.