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Assay and drug development technologies2005Oct01Vol.3issue(5)

正確なIC50決定に必要なデータポイントの最小数を評価する

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文献タイプ:
  • Evaluation Study
  • Journal Article
概要
Abstract

組み合わせ化学技術により、従来の化合物アーカイブよりもはるかに高い薬理学的に活性化合物の比率で構成される大規模なターゲットライブラリの合成が可能になりました。これにより、予備画面の後に完全な50%阻害濃度(IC50)曲線でフォローアップの特性評価を必要とする化合物の数が多くなりました。この研究の目的は、データポイントの最小数からのIC50決定のための新しいアッセイ形式と分析プロトコルを開発して、より多くの情報を一次阻害スクリーンから導き出すことができるようにすることでした。既存の10ポイントIC50曲線からのデータポイントは、1つまたは2つの化合物濃度から導出されたIC50予測の精度をテストするために遡及的に使用されました。回帰分析により、両方の方法が有用であることが示されましたが、予想どおり、2つの化合物濃度により、より正確なIC50予測が得られました。2ポイントおよび10ポイントアッセイ形式から派生したIC50値を比較する最終的な実験データセットは、非常に同等のデータを提供しました(R2 = 0.89)。この研究は、2つの化合物濃度を使用して適切に設計された一次阻害スクリーンからIC50値を生成し、フォローアップIC50の決定の要件を減らすことが可能であることを示しています。

組み合わせ化学技術により、従来の化合物アーカイブよりもはるかに高い薬理学的に活性化合物の比率で構成される大規模なターゲットライブラリの合成が可能になりました。これにより、予備画面の後に完全な50%阻害濃度(IC50)曲線でフォローアップの特性評価を必要とする化合物の数が多くなりました。この研究の目的は、データポイントの最小数からのIC50決定のための新しいアッセイ形式と分析プロトコルを開発して、より多くの情報を一次阻害スクリーンから導き出すことができるようにすることでした。既存の10ポイントIC50曲線からのデータポイントは、1つまたは2つの化合物濃度から導出されたIC50予測の精度をテストするために遡及的に使用されました。回帰分析により、両方の方法が有用であることが示されましたが、予想どおり、2つの化合物濃度により、より正確なIC50予測が得られました。2ポイントおよび10ポイントアッセイ形式から派生したIC50値を比較する最終的な実験データセットは、非常に同等のデータを提供しました(R2 = 0.89)。この研究は、2つの化合物濃度を使用して適切に設計された一次阻害スクリーンからIC50値を生成し、フォローアップIC50の決定の要件を減らすことが可能であることを示しています。

Combinatorial chemistry technology has enabled the synthesis of large, targeted libraries consisting of a much higher ratio of pharmacologically active compounds than traditional compound archives. This has resulted in a higher number of compounds requiring follow-up characterisation in full 50% inhibitory concentration (IC50) curves after the preliminary screen. The aim of this study was to develop a new assay format and analysis protocol for IC50 determination from the minimum number of data points so that more information could be derived from a primary inhibition screen. Data points from existing 10-point IC50 curves were used retrospectively to test the accuracy of IC50 predictions derived from just one or two compound concentrations. Regression analysis showed that both methods were useful, although, as expected, two compound concentrations gave more accurate IC50 predictions. A final experimental data set comparing IC50 values derived from a two- and 10- point assay format gave highly comparable data (r2 = 0.89). This study shows that it is possible to generate IC50 values from an appropriately designed primary inhibition screen using two compound concentrations, reducing the requirement for follow-up IC50 determinations.

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