アーミッシュの認知症のゲノム全体の連鎖分析

アルツハイマー病の感受性遺伝子は、検出と検証が非常に困難であることが証明されています。人口の不均一性は、この困難に寄与する重要な交絡因子である可能性があります。疾患感受性遺伝子検出の能力を高めるために、比較的孤立した遺伝的に均質なアーミッシュ集団の個人を使用して、ゲノム全体の遺伝的結合スクリーンを実施しました。私たちのゲノム連鎖分析は、407ミクロサテライトマーカーマップ（平均密度7 cm）を使用して、米国中西部の4つの郡の5つのアーミッシュ家の認知症に関連する常染色体遺伝子を検索しました。私たちの最高の2点LODスコア（3.01）は、染色体4Q31のマーカーD4S1548で観察されました。他の5つの地域（10q22、3q28、11p13、4q28、19p13）も、2点LODスコアを> 2.0を持つマーカーとの示唆的なリンクを示しました。これらの領域のうち2つは新規（4q31および11p13）ですが、他の領域は他の集団の以前のゲノムスキャンで特定された領域の近くにあります。我々の結果は、認知症患者、特に北米のアーミッシュコミュニティのサブセットに関与する遺伝子を抱く可能性のあるゲノムの領域を特定しています。

Susceptibility genes for Alzheimer's disease are proving to be highly challenging to detect and verify. Population heterogeneity may be a significant confounding factor contributing to this difficulty. To increase the power for disease susceptibility gene detection, we conducted a genome-wide genetic linkage screen using individuals from the relatively isolated, genetically homogeneous, Amish population. Our genome linkage analysis used a 407-microsatellite-marker map (average density 7 cM) to search for autosomal genes linked to dementia in five Amish families from four Midwestern U.S. counties. Our highest two-point lod score (3.01) was observed at marker D4S1548 on chromosome 4q31. Five other regions (10q22, 3q28, 11p13, 4q28, 19p13) also demonstrated suggestive linkage with markers having two-point lod scores >2.0. While two of these regions are novel (4q31 and 11p13), the other regions lie close to regions identified in previous genome scans in other populations. Our results identify regions of the genome that may harbor genes involved in a subset of dementia patients, in particular the North American Amish community.