Agrobacterium Tumefaciens Transfer DNA（T-DNA）の統合には、標的植物DNA配列の再配列が含まれます

Agrobacterium Tumefaciensによって植物細胞に動員されたトランスファーDNA（T-DNA）は、植物のゲノムにかなりランダムに統合されているようです。T-DNAの統合の前後に、ニコチアナタバカムのゲノムの標的部位を分析しました。T-DNA挿入イベントの植物DNAターゲット部位に対応する一意の1.8キロゼートECORIフラグメントを識別および隔離するためのプローブとして右と左のT-DNA/植物DNA接合を提示するクローンを使用しました。T-DNA接合クローンの植物DNA部分のヌクレオチド配列と元の植物DNA標的との比較により、T-DNAの挿入に起因するいくつかのタイプの再配置が生じることが明らかになりました。最も劇的な変化は、左右のT-DNA接合部でのターゲットプラントシーケンスの158ベースペアの直接反復でした。さらに、158ベースペアリピートの右側と左コピーの端に削除および挿入イベントがありました。ターゲットサイトのさまざまな再配列は、T-DNA挿入が、宿主細胞酵素によって媒介される局所的な複製および修復活動を伴う組換えの多段階プロセスであることを示唆しています。

The transfer DNA (T-DNA) mobilized into plant cells by Agrobacterium tumefaciens seems to integrate rather randomly into the plant genome. We analyzed a target site in the genome of Nicotiana tabacum before and after integration of a T-DNA. Clones presenting right and left T-DNA/plant DNA junctions were used as probes to identify and isolate a unique 1.8-kilobase EcoRI fragment corresponding to the plant DNA target site for a T-DNA insertion event. Comparison of the nucleotide sequences of the plant DNA portions of the T-DNA junction clones with the original plant DNA target revealed that several types of rearrangements resulted from insertion of the T-DNA. The most dramatic alteration was a 158-base-pair direct repeat of target plant sequences at the left and right T-DNA junctions. In addition, there were deletion and insertion events at the ends of the right and left copies of the 158-base-pair repeat. The variety of target-site rearrangements suggests that T-DNA insertion is a multistep process of recombination accompanied by local replicative and repair activities mediated by host-cell enzymes.