ニドウイルス転写：意味をなす方法は？

多くの陽性密接なRNAウイルスは、サブ遺伝子mRNAを使用して遺伝情報の一部を発現します。構造タンパク質とアクセサリータンパク質を生成するために、Nidoviralesのオーダー（Corona-、Toro-、Arteri-、およびRoniviruses）のメンバーは、少なくとも3つ、頻繁に7〜9のmRNAの3 '共末端ネストセットを生成します。コロナウイルスおよび動脈膜下転写産物は、3 '共末端であるだけでなく、ゲノム5'端から導出される一般的な5 'リーダーシーケンスも含まれています。それらの合成には、類似性支援RNA組換えに似た不連続RNA合成のプロセスが含まれます。過去25年間にわたって提案されているほとんどのモデルは、サブ遺伝子RNAリーダーと体配列の同時転写融合を想定していますが、プラスまたはマイナス鎖合成中にこれが発生するかどうかという問題については論争がありました。現在、かなりのサポートを得ている後者のモデルでは、不連続なマイナス鎖合成によって生成されるサブゲノムサイズマイナスストランドRNAの相補的なセットからサブ遺伝子mRNA合成が行われます。Sense-Antisense短い保存されたシーケンス間のベースペアリング相互作用は、このプロセスで重要な規制の役割を果たします。推定されているニドウイルスの共通の祖先を考慮して、ロニビロスとトロウイルスmRNAには一般的な5 'リーダーシーケンスが含まれていないという最近の発見は驚くべきことです。どうやら、ニドウイルスの間に大きな機構の違いが存在する必要があり、それが共通のリーダー配列の機能とニドウイルス転写酵素タンパク質の機能とニドウイルス転写の進化に関する疑問を提起する必要があります。このレビューでは、ニドウイルス転写メカニズムが比較され、使用される実験システムが批判的に評価され、特に最近開発された逆遺伝システムの影響について説明します。

Many positive-stranded RNA viruses use subgenomic mRNAs to express part of their genetic information. To produce structural and accessory proteins, members of the order Nidovirales (corona-, toro-, arteri- and roniviruses) generate a 3' co-terminal nested set of at least three and often seven to nine mRNAs. Coronavirus and arterivirus subgenomic transcripts are not only 3' co-terminal but also contain a common 5' leader sequence, which is derived from the genomic 5' end. Their synthesis involves a process of discontinuous RNA synthesis that resembles similarity-assisted RNA recombination. Most models proposed over the past 25 years assume co-transcriptional fusion of subgenomic RNA leader and body sequences, but there has been controversy over the question of whether this occurs during plus- or minus-strand synthesis. In the latter model, which has now gained considerable support, subgenomic mRNA synthesis takes place from a complementary set of subgenome-size minus-strand RNAs, produced by discontinuous minus-strand synthesis. Sense-antisense base-pairing interactions between short conserved sequences play a key regulatory role in this process. In view of the presumed common ancestry of nidoviruses, the recent finding that ronivirus and torovirus mRNAs do not contain a common 5' leader sequence is surprising. Apparently, major mechanistic differences must exist between nidoviruses, which raises questions about the functions of the common leader sequence and nidovirus transcriptase proteins and the evolution of nidovirus transcription. In this review, nidovirus transcription mechanisms are compared, the experimental systems used are critically assessed and, in particular, the impact of recently developed reverse genetic systems is discussed.