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Biochemistry1975Jul29Vol.14issue(15)

水性マグネシウム塩溶液におけるDNA融解遷移

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.
概要
Abstract

DNAのマグネシウム塩の融解遷移は、さまざまなタイプの陰イオンの存在下で体系的に調べられています。CLO4-を3.0 Nの濃度に添加すると、二相性光学転移が生じ、最初の相はDNA濃度の急速な可逆性と独立性を示します。崩壊した型のDNAに対する分子内凝縮として解釈されるこのサブトランスションの後に、DNA濃度依存性凝集反応が続きます。凝集は、温度を移動後レベルに上げながら、CLO4-濃度を6.0 Nに増加させることで逆転させることができます。あるいは、報告されているDNAの最も強くカオトロピック溶媒であるトリクロロ酢酸の存在下で融解することにより、崩壊と凝集の両方を防ぐことができます(K. hamaguchi and E. P. geiduschek(1962)、J。Am。Chem。Soc。84、1329)。崩壊と凝集の両方を媒介する力は、デュプレックスの安定性の維持に関与するものと表面的に類似しています。特に、崩壊した形は、ポリエチレングリコールなどの特定のポリマーの水溶液で生成できる凝縮構造と共通の特徴を持っている可能性があります(Lerman、L.S。(1971)、Proc。Natl。Acad。Sci。Sci。68、1886)。

DNAのマグネシウム塩の融解遷移は、さまざまなタイプの陰イオンの存在下で体系的に調べられています。CLO4-を3.0 Nの濃度に添加すると、二相性光学転移が生じ、最初の相はDNA濃度の急速な可逆性と独立性を示します。崩壊した型のDNAに対する分子内凝縮として解釈されるこのサブトランスションの後に、DNA濃度依存性凝集反応が続きます。凝集は、温度を移動後レベルに上げながら、CLO4-濃度を6.0 Nに増加させることで逆転させることができます。あるいは、報告されているDNAの最も強くカオトロピック溶媒であるトリクロロ酢酸の存在下で融解することにより、崩壊と凝集の両方を防ぐことができます(K. hamaguchi and E. P. geiduschek(1962)、J。Am。Chem。Soc。84、1329)。崩壊と凝集の両方を媒介する力は、デュプレックスの安定性の維持に関与するものと表面的に類似しています。特に、崩壊した形は、ポリエチレングリコールなどの特定のポリマーの水溶液で生成できる凝縮構造と共通の特徴を持っている可能性があります(Lerman、L.S。(1971)、Proc。Natl。Acad。Sci。Sci。68、1886)。

The melting transition of the magnesium salt of DNA has been systematically examined in the presence of various types of anions. The addition of ClO4- to a concentration of 3.0 N results in the biphasic optical transition, with the first phase exhibiting rapid reversibility and independence of the DNA concentration. This subtransition, which is interpreted as an intramolecular condensation to a collapsed form of DNA, is followed by a DNA concentration-dependent aggregation reaction. The aggregation can be reversed by increasing the ClO4- concentration to 6.0 N while elevating the temperature to post-transition levels. Alternatively, both the collapse and the aggregation can be prevented by melting in the presence of trichloroacetate, the most strongly chaotropic solvent for DNA which has been reported (K. Hamaguchi and E. P. Geiduschek (1962), J. Am. Chem. Soc. 84, 1329). The forces responsible for mediating both the collapse and the aggregation are superficially similar to those involved in maintaining duplex stability. The collapsed form, in particular, possibly possesses features in common with the condensed structures which can be produced in aqueous solution of certain polymers, such as polyethylene glycol (Lerman, L.S. (1971), Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 68, 1886).

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