マウスのマイナー衛星DNAは、遺伝的にセントロメアをマッピングし、近位テロメアに物理的にリンクしています

ヒトのセントロメアで機能的に重要なシーケンスを定義しようとする試みの補助として、マウス内のこれらの領域の長距離物理分析を実施しました。マウスのセントロメアは通常、染色体の端に非常に近い位置にあり、細胞学的観察に基づいてマイナーな衛星シーケンスと密接に関連しています。パルスフィールドゲル電気泳動を使用して、この衛星DNAはタンデムアレイとして配置されており、主にノンサテライトシーケンスによって途切れないことがわかります。これらのアレイは、一般的に非衛星DNAで頻繁に切断するさまざまな酵素を使用して消化することにより、ほとんど無傷の放出ができます。これらのアレイを運ぶ制限フラグメントは、近交系の間のサイズが多型であり、マウスセントロメアの直接マーカーを提供します。これらの多型マーカーの使用の可能性を説明するために、染色体7のCentromereに1.3 MB PVUIIバリアントをマッピングしました。容易に検出され、1 MB未満の端子制限フラグメントに多くのマイナーな衛星アレイを配置します。マイナーな衛星と端子リピートアレイの間にかなりの量の非触虫DNAが明らかにないことは、多くのマウス染色体が本当にテロセントリックであることを示しています。

As an adjunct to attempts to define functionally important sequences at human centromeres, we have undertaken a long-range physical analysis of these regions in the mouse. Mouse centromeres are usually situated very close to the chromosome ends and are closely associated with minor satellite sequences on the basis of cytological observations. Using pulsed-field gel electrophoresis we find that this satellite DNA is arranged as tandem arrays, predominantly uninterrupted by nonsatellite sequences. These arrays can be released largely intact by digestion with a range of enzymes that generally cleave frequently in non-satellite DNA. The restriction fragments carrying these arrays are polymorphic in size between inbred strains and provide direct markers for mouse centromeres. To illustrate the possible use of these polymorphic markers we have mapped a 1.3-Mb PvuII variant in a set of RI strains to the centromere of Chromosome 7. The minor satellite arrays are very close to the centromeric telomere and physical linkage with terminal repeat sequences can readily be detected, placing many minor satellite arrays on terminal restriction fragments smaller than 1 Mb. The apparent lack of any sizable amount of nonsatellite DNA between the minor satellite and the terminal repeat arrays indicates that many mouse chromosomes are truly telocentric.